RNA–Protein interactions for RNA: YGR104C

SRB5, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB5, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB5	YGR104C	FUS2	Q05670	677 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	DSE3	Q08729	430 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	VIK1	Q12045	647 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	USV1	Q12132	391 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SRN2	Q99176	213 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MTF2	P10849	440 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	PRE8	P23639	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RDS1	P25611	832 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	NUF2	P33895	451 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	DAD2	P36162	133 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	APD1	P38281	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SHC1	P39000	512 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YER010C	P40011	234 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	EFM4	P40516	257 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	LYS14	P40971	790 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YGL242C	P53066	181 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SKY1	Q03656	742 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	URC2	Q04411	772 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RTT103	Q05543	409 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	THI22	Q06490	572 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	VAC14	Q06708	880 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	TLG2	Q08144	397 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	DIN7	Q12086	430 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	GIS3	Q12418	502 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	UNG1	P12887	359 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	CLB1	P24868	471 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	BOS1	P25385	244 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YCL049C	P25577	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	NTH1	P32356	751 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	COT1	P32798	439 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	STB6	P36085	766 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YKR015C	P36111	568 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	HEL1	P36113	551 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	NUP133	P36161	1157 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	POP7	P38291	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YHR054C	P38780	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SNZ3	P43545	298 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	BNA6	P43619	295 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ASK10	P48361	1146 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	TAF4	P50105	388 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	GLO1	P50107	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MNT2	P53059	558 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	DSD1	P53095	428 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	CUL3	P53202	744 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	COX18	P53239	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YGR151C	P53287	111 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SNZ2	P53824	298 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	PGA2	P53903	129 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YNL146W	P53906	100 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ESBP6	P53918	673 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MAK10	Q02197	733 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SPC2	Q04969	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MSC3	Q05812	728 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	BCP1	Q06338	283 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	TRM8	Q12009	286 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	LDB17	Q12342	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	NUC1	P08466	329 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.34	□□□□□ -1.71	not detected
SRB5	YGR104C	HOP1	P20050	605 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MRPL8	P22353	238 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SUA5	P32579	426 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	TMT1	P32643	299 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	BCS1	P32839	456 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	PRM9	P39551	298 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RSM25	P40496	264 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	MSS2	P40990	351 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SRB5	YGR104C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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