RNA–Protein interactions for RNA: YGR084C

MRP13, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP13, Length 1,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP13	YGR084C	VCX1	Q99385	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	BNI1	P41832	1953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SNT2	P53127	1403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PAH1	P32567	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PXL1	P36166	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SWP82	P43554	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	CTK2	P46962	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PFA5	Q03289	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MRP13	YGR084C	SPO14	P36126	1683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ERG8	P24521	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ATO2	P32907	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ECM10	P39987	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YER010C	P40011	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	REG1	Q00816	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SPC19	Q03954	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	RCO1	Q04779	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ECI1	Q05871	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	TRM8	Q12009	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ENT1	Q12518	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	DRS2	P39524	1355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PET111	P08468	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	STE50	P25344	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	CBK1	P53894	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	NBP2	Q12163	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SEM1	O94742	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	MRP7	P12687	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	AAC3	P18238	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	CBF2	P32504	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ASI1	P54074	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	NUP53	Q03790	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SRL1	Q08673	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	DSE3	Q08729	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	CHO1	P08456	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YEL068C	P39977	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PCL6	P40038	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YIL152W	P40455	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SMC3	P47037	1230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	MUB1	Q03162	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SNA4	Q07549	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	NUP170	P38181	1502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	CDC16	P09798	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ESL2	P36168	1195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	ARP10	Q04549	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	SNO4	Q04902	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	MCP2	Q06567	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	MLH2	Q07980	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	BUD7	Q08754	746 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	HSP32	Q08992	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRP13	YGR084C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	PSD1	P39006	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	PKP1	P40530	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	IME4	P41833	600 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	SGM1	P47166	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	CLB2	P24869	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	MRP20	P32387	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	VRG4	P40107	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	VTC2	P43585	828 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	YNR061C	P53747	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	YKU80	Q04437	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	BUD3	P25558	1636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	MET8	P15807	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRP13	YGR084C	MNN2	P38069	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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