RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YOL159C-AQ3E769 90 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SAS5Q99314 248 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SUC2P00724 532 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PDE2P06776 526 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W LEU1P07264 779 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PAH1P32567 862 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YKL063CP35725 167 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CCT6P39079 546 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YEL020CP39994 560 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SEC28P40509 296 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SAP4P53036 818 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CWC25P53854 179 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W MUK1Q02866 612 aa12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data12.66□□□□□ -0.38not detected
SSA4YER103W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ENA1P13587 1091 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W PPZ1P26570 692 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W NDI1P32340 513 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W SMI1P32566 505 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W UTP7P40055 554 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W CNN1P43618 361 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W YGR127WP53275 312 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ENA2Q01896 1091 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W GPI11Q06636 219 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W RAX1Q08760 435 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W TRM10Q12400 293 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W ENA5Q12691 1091 aa12.65□□□□□ -0.38
SSA4YER103W THP2O13539 261 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W GPH1P06738 902 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ASP3-2P0CX77 362 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ASP3-3P0CX78 362 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ASP3-4P0CX79 362 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ASP3-1P0CZ17 362 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W NOP4P37838 685 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W VID24P38263 362 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W GIP4P39732 760 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YGR053CP53234 283 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W PGC1Q08959 321 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ATP16Q12165 160 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W GRX2P17695 143 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W DBR1P24309 405 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W PUP3P25451 205 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W PEP7P32609 515 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W IPT1P38954 527 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W EAF5P39995 279 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W UGO1Q03327 502 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W COX20Q04935 205 aa12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ERG20P08524 352 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ATP12P22135 325 aa12.63□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SSA4YER103W FHL1P39521 936 aa12.63□□□□□ -0.39
SSA4YER103W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SSA4YER103W HUA2Q12134 243 aa12.63□□□□□ -0.39
SSA4YER103W GIT1P25346 518 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W NTG1P31378 399 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W FUN30P31380 1131 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W NMD3P38861 518 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W COS4P43542 379 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W MPS3P47069 682 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W IMP4P53941 290 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W TOF2Q02208 771 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YML037CQ03703 340 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W RAD59Q12223 238 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W GTT2Q12390 233 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W FMP16Q12497 93 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YPL247CQ12523 523 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ARG3P05150 338 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W HMG1P12683 1054 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W PRR1P28708 518 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W SHP1P34223 423 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YKL100CP34248 587 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W PPE1P38796 400 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W MTG2P38860 518 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YEN1P40028 759 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W YOL019WQ08157 551 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W RTR2Q12378 196 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W MHF1Q3E835 90 aa12.62□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SSA4YER103W VBA3P25594 458 aa12.61□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SSA4YER103W VBA5P36172 582 aa12.61□□□□□ -0.39
SSA4YER103W GPX2P38143 162 aa12.61□□□□□ -0.39
SSA4YER103W MMS4P38257 691 aa12.61□□□□□ -0.39
SSA4YER103W ARN2P38724 620 aa12.61□□□□□ -0.39
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