RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B PXL1P36166 706 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B STN1P38960 494 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B BEM4P39011 633 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RPH1P39956 796 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B GAT2P40209 560 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PUS2P53167 370 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B SED5Q01590 340 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YSA1Q01976 231 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B HDA2Q06629 674 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B ENT4Q07872 247 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MPC54Q08550 464 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B HAL9Q12180 1030 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YOL107WQ12239 342 aa3.14□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B AI1P03875 834 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RPB10P22139 70 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PHO84P25297 587 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B GID7P25569 745 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MRPL9P31334 269 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B KAP122P32767 1081 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MRS6P32864 603 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B SFC1P33303 322 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MAL32P38158 584 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B EHT1P38295 451 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MMS21P38632 267 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B LYS9P38999 446 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B ATM1P40416 690 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL152WP40455 235 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B IRR1P40541 1150 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B FIG4P42837 879 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RRT5P43607 289 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YJL049WP47048 450 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B COG1P53079 417 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B HOP2P53187 214 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B LSC2P53312 427 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC14Q00684 551 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B SND1Q04007 877 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B GRX8Q05926 109 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YOR376WQ08900 122 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PGC1Q08959 321 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS5Q92331 675 aa3.13□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B CCW14O13547 238 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PUT4P15380 627 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B TYR1P20049 452 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B BAS1P22035 811 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B VAN1P23642 535 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PTC6P25646 442 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MCM2P29469 868 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B NUD1P32336 851 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B UGP1P32861 499 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RPS27AP35997 82 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B FUI1P38196 639 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RPS27BP38711 82 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B DBP8P38719 431 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B FET3P38993 636 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B VFA1P40080 203 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PHO86P46956 311 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B TIM10P87108 93 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B ARP9Q05123 467 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B CYK3Q07533 885 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B THI21Q08975 551 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B ELG1Q12050 791 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B TY4A-HQ6Q5P6 413 aa3.12□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B BI2P03873 423 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MOD5P07884 428 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B PBS2P08018 668 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B FUM1P08417 488 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B CMP2P14747 604 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B AGP1P25376 633 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MSH1P25846 959 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B AEP1P32493 518 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B SMC1P32908 1225 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YBR139WP38109 508 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YHL041WP38730 149 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B APE4P38821 490 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MNL1P38888 796 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B MSS4P38994 779 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL054WP40524 105 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B TFG1P41895 735 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YJL107CP42947 387 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B RGD2P43556 714 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B SAP4P53036 818 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR127WP53275 312 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B HST1P53685 503 aa3.11□□□□□ -1.91
tC(GCA)BtC(GCA)B DUG3P53871 357 aa3.11□□□□□ -1.91
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