RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C NTH1P32356 751 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YSW1P38280 609 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YBP1P38315 674 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MMS21P38632 267 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SEO1P39709 593 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C LRO1P40345 661 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SPG5P42933 373 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ARP4P80428 489 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C TRS31Q03337 283 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C VID22Q05934 901 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C IMA2Q08295 589 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C HRK1Q08732 759 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C LDB17Q12342 491 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YOR012WQ12351 137 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RMD5Q12508 421 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C PTP1P25044 335 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YCR006CP25350 157 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C GUT2P32191 649 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C CNS1P33313 385 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SKN1P33336 771 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MIC60P36112 540 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PCH2P38126 564 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YHR033WP38690 423 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SMF2P38778 549 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data6.89□□□□□ -1.31not detected
SPE3YPR069C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TY4A-JP47023 414 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HST3P53687 447 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C CPR6P53691 371 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ROT1Q03691 256 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RRN11Q04712 507 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C GRS2Q06817 618 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YLR030WQ07967 263 aa6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SLH1P53327 1967 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SWI5P08153 709 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C GID7P25569 745 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C HOG1P32485 435 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SRB4P32569 687 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C DOM34P33309 386 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SQT1P35184 431 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C KES1P35844 434 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C NTR2P36118 322 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MRP21P38175 177 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ACO2P39533 789 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ALA1P40825 983 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PXA1P41909 870 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ALK1P43633 760 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RIM21P48565 533 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PEX8P53248 589 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PET117Q02771 107 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C VHS1Q03785 461 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SIZ1Q04195 904 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TDA9Q04545 1251 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C VTA1Q06263 330 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SLD7Q08457 257 aa6.88□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data6.87□□□□□ -1.31not detected
SPE3YPR069C EMC3P36039 253 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RPF2P36160 344 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TRM7P38238 310 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SSN3P39073 555 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C GIM4P40005 111 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C LSM5P40089 93 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SCC4P40090 624 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C FAU1P40099 211 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SEC9P40357 651 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TAH11P47112 604 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RIM8P53179 542 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C EAF7P53911 425 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ECM9Q02202 377 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TFB2Q02939 513 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TRS23Q03784 219 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YDR109CQ04585 715 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C DIN7Q12086 430 aa6.87□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C INO1P11986 533 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C AMD1P15274 810 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PET112P33893 541 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C STO1P34160 861 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C PEX5P35056 612 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C MSG5P38590 489 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C UBA4P38820 440 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C TIF11P38912 153 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ARH1P48360 493 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RTA1P53047 317 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C ARE2P53629 642 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C SUR7P54003 302 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C OSH6Q02201 448 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C YOL024WQ08172 172 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C AIM41Q12032 185 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C GLE1Q12315 538 aa6.86□□□□□ -1.31
SPE3YPR069C FUM1P08417 488 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms