RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	COX4	P04037	155 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RAP1	P11938	827 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SEC61	P32915	480 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PRK1	P40494	810 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	AIM23	P47015	356 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SPP1	Q03012	353 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	FAR10	Q06001	478 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	GSH2	Q08220	491 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	GCR1	P07261	785 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ABF1	P14164	731 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MER1	P16523	270 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TFC1	P32367	649 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YJL206C	P39529	758 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MGS1	P40151	587 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MRPS18	P42847	217 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	VTC4	P47075	721 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TPN1	P53099	579 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MND1	P53102	219 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	NSE5	Q03718	556 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ATG34	Q12292	412 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HAT1	Q12341	374 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MMP1	Q12372	583 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CCA1	P21269	546 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	APT2	P36973	181 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	FMP10	P40098	244 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CIN1	P40987	1014 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YNR068C	P53754	272 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YMR279C	Q03263	540 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RSN1	Q03516	953 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YPD1	Q07688	167 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PEP5	P12868	1029 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	UBC8	P28263	218 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SOK1	P40317	901 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YPR084W	Q06821	456 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ULA1	Q12059	462 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SKM1	Q12469	655 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HIS5	P07172	385 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HEM15	P16622	393 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RSC6	P25632	483 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SPR1	P32603	445 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CPR5	P35176	225 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	NPR2	P39923	615 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	BIO3	P50277	480 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SPC98	P53540	846 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SEG1	Q04279	960 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ADY4	Q05955	493 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	THI21	Q08975	551 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	NDI1	P32340	513 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	JEN1	P36035	616 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YBL086C	P38177	466 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	COS111	P38308	924 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.34	□□□□□ -1.55	not detected
RGT1	YKL038W	END3	P39013	349 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	EMP65	P40085	556 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YMR134W	P40207	237 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YJL049W	P47048	450 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ARL3	Q02804	198 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TFC6	Q06339	672 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.34	□□□□□ -1.55	not detected
RGT1	YKL038W	SNF3	P10870	884 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MRPL8	P22353	238 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HYM1	P32464	399 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RXT2	P38255	430 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YFL040W	P43562	540 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	NUT1	P53114	1132 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	JAC1	P53193	184 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SNF12	P53628	566 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	DSE4	P53753	1117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	IVY1	Q04934	453 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ARP7	Q12406	477 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
RGT1	YKL038W	FUN26	P31381	517 aa		5.34	□□□□□ -1.56
RGT1	YKL038W	KAP122	P32767	1081 aa		5.34	□□□□□ -1.56
RGT1	YKL038W	SET3	P36124	751 aa		5.34	□□□□□ -1.56
RGT1	YKL038W	POP4	P38336	279 aa		5.34	□□□□□ -1.56
RGT1	YKL038W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.3 ms