RNA–Protein interactions for RNA: YJR111C

YJR111C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YJR111C, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR111CYJR111C SNT1P25357 1226 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C MSP1P28737 362 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C GYP6P32806 458 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C LOT5P34234 306 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C HCS1P34243 683 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C CCL1P37366 393 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C CTP1P38152 299 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C MAM1P40065 302 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C LTP1P40347 161 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YIL077CP40508 320 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C PKP1P40530 394 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C LCB2P40970 561 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C ZIM17P42844 174 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C SMC3P47037 1230 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C TCB2P48231 1178 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C MLC1P53141 149 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C CUL3P53202 744 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YGR111WP53265 400 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YGR127WP53275 312 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C SNF12P53628 566 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YPL107WQ02873 248 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YMR206WQ03695 313 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YML037CQ03703 340 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C ARG7Q04728 441 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C IZH3Q07959 543 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C SPE4Q12455 300 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C YOL159C-AQ3E769 90 aa3.59□□□□□ -1.83
YJR111CYJR111C MF(ALPHA)1P01149 165 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C MET3P08536 511 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C DPH2P32461 534 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SMI1P32566 505 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C TFB1P32776 642 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C RRP1P35178 278 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C HES1P35843 434 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C HEL1P36113 551 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SRO77P38163 1010 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YHR131CP38835 850 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C LNP1P38878 278 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C JHD1P40034 492 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YNL195CP40168 261 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C HXT14P42833 540 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C APT1P49435 187 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C FMS1P50264 508 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C TOF1P53840 1238 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C EFM6P53970 246 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SKO1Q02100 647 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C DLT1Q04216 342 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C ROY1Q04847 553 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C CRF1Q04930 467 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C NFI1Q12216 726 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C HER1Q12276 1246 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C FRE6Q12473 712 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.58□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C APN1P22936 367 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C POL4P25615 582 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C BUD14P27637 709 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YJR111CYJR111C NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C CDC5P32562 705 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SEF1P34228 1148 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C MIC60P36112 540 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C EHT1P38295 451 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YHR054CP38780 354 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C VPS45P38932 577 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C MRX1P40050 688 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C TMN3P40071 706 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C SEC27P41811 889 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C CTK2P46962 323 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C MTL1P53214 551 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C TAM41P53230 385 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C ERG5P54781 538 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C YAT1P80235 687 aa3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YJR111CYJR111C RBA50Q04418 439 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms