RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W MTG2P38860 518 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ALG8P40351 577 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ROT1Q03691 256 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W VTA1Q06263 330 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MPC54Q08550 464 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HOP1P20050 605 aa8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RAD57P25301 460 aa8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YHR182WP38870 785 aa8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NUT2Q06213 157 aa8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W DIN7Q12086 430 aa8.9□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W CNS1P33313 385 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W PET112P33893 541 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W TRM7P38238 310 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YHL008CP38750 627 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W TCD1P38756 429 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W GIM4P40005 111 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ALA1P40825 983 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ASK10P48361 1146 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W BTN2P53286 410 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W CPR6P53691 371 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ECM9Q02202 377 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W TRS31Q03337 283 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ENT2Q05785 613 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W VPS38Q05919 439 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W GRS2Q06817 618 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W AVL9Q12500 764 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W TRA1P38811 3744 aa8.89□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W AI4P03878 556 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ERR1P0CX10 437 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ERR2P0CX11 437 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W KES1P35844 434 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RPF2P36160 344 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W END3P39013 349 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ACO2P39533 789 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ERR3P42222 437 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W TAH11P47112 604 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W NNF1P47149 201 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W OSH6Q02201 448 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W APL4Q12028 832 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data8.88□□□□□ -0.99not detected
CPD1YGR247W YOR012WQ12351 137 aa8.88□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W QCR6P00127 147 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W MST1P07236 462 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RPL43BP0CX26 92 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W TSR4P25040 408 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W LYP1P32487 611 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YSW1P38280 609 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W SMF2P38778 549 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W DPH1P40487 425 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RSF1Q05043 376 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W GYP1Q08484 637 aa8.87□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W BCY1P07278 416 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W IMG1P25626 169 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W SIN4P32259 974 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W GDA1P32621 518 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W SSN3P39073 555 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W PXA1P41909 870 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W PET117Q02771 107 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W BMT6Q12291 365 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W HSP42Q12329 375 aa8.86□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W SWI5P08153 709 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W HOP09932 586 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W RSC6P25632 483 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W SMI1P32566 505 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W DEF1P35732 738 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W FMP46P36141 133 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W MRP21P38175 177 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W SEO1P39709 593 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YMR134WP40207 237 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W PEX25Q02969 394 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W CDA2Q06703 312 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YPL272CQ08984 517 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YPL066WQ12194 479 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W LAG2Q92325 660 aa8.85□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W INO1P11986 533 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W AMD1P15274 810 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W FUR1P18562 216 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W GUT2P32191 649 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W PEX5P35056 612 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W MPE1P35728 441 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YHR045WP38775 560 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W EFM4P40516 257 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W IKS1P47042 667 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W PEX8P53248 589 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ESF2P53743 316 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W ALF1P53904 254 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W YDR109CQ04585 715 aa8.84□□□□□ -0.99
CPD1YGR247W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
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