RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C NTH1P32356 751 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data6.64□□□□□ -1.35not detected
SHO1YER118C YKT6P36015 200 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YBL028CP38202 106 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YHR112CP38716 378 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C LRO1P40345 661 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SEC24P40482 926 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SMC3P47037 1230 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C CTR1P49573 406 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C STR3P53101 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YNL143CP53908 130 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C BOP3P53958 396 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SIZ1Q04195 904 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SYT1Q06836 1226 aa6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHO1YER118C HIP1P06775 603 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C KIN2P13186 1147 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C HMX1P32339 317 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C HXT3P32466 567 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SRB5P32585 307 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C WBP1P33767 430 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C AGP2P38090 596 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SIC1P38634 284 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YTA12P40341 825 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C GTS1P40956 396 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C IDS2P46958 469 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C LIA1P47120 325 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C COS12P53053 380 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C VPS20Q04272 221 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C OPT2Q06593 877 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YDR061WQ12298 539 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ECM3Q99252 613 aa6.63□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SPE1P08432 466 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C VPS33P20795 691 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C DCG1P32460 244 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RML2P32611 393 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ARC19P33204 171 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C HCS1P34243 683 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C TCD2P36101 447 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YBR259WP38338 688 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C PEX18P38855 283 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ECM1P39715 212 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C AFG3P39925 761 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ELP2P42935 788 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YNL144CP53907 740 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C INA17Q02888 182 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YLR346CQ06139 101 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YLR413WQ06689 675 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YVC1Q12324 675 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YRM1Q12340 786 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ADF1Q2V2Q1 113 aa6.62□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YLR278CQ05854 1341 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YLR415CO13578 112 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C TDH1P00360 332 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SUP35P05453 685 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C LRE1P25579 583 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SMY1P32364 656 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C MRPL4P36517 319 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C GIP4P39732 760 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YER034WP40022 185 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SER3P40054 469 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C CRF1Q04930 467 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C PCL8Q08966 492 aa6.61□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YML133CQ03099 1374 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YLL067CQ07888 1374 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YLL066CQ99208 1374 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YML003WP0CF16 290 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C PRP4P20053 465 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C PDB1P32473 366 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C PEX32P38292 413 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YNG2P38806 282 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C MLH1P38920 769 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YJL206CP39529 758 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C EFM3P47163 339 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C FMS1P50264 508 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SMA1Q02651 245 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C HOF1Q05080 669 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C GSH2Q08220 491 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C TY3A-GQ12173 290 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C TY1A-BLQ12266 440 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C TY3A-IQ99219 290 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RAD61Q99359 647 aa6.6□□□□□ -1.35
SHO1YER118C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SHO1YER118C SEC15P22224 910 aa6.59□□□□□ -1.35
SHO1YER118C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SHO1YER118C CAD1P24813 409 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SHO1YER118C YCR061WP25639 631 aa6.59□□□□□ -1.35
SHO1YER118C CDC15P27636 974 aa6.59□□□□□ -1.35
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