RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RRT2	P38332	387 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YAP3	P38749	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PEX18	P38855	283 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PKP1	P40530	394 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TED1	P40533	473 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.25	□□□□□ -1.73	not detected
SYF1	YDR416W	CLA4	P48562	842 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YDL183C	P48569	320 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	LCL3	P53153	274 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ASM4	Q05166	528 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	UAF30	Q08747	228 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	BUD7	Q08754	746 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PCL8	Q08966	492 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CLC1	P17891	233 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SPC110	P32380	944 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CMC1	P36064	111 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YBP2	P53169	641 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TAM41	P53230	385 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SVS1	Q12254	260 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YRM1	Q12340	786 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	AFG1	P32317	509 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GEX2	P36173	615 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YHL017W	P38745	532 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DSE4	P53753	1117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	VPS38	Q05919	439 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	VPS36	Q06696	566 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DMC1	P25453	334 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	HMX1	P32339	317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PMT1	P33775	817 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PIM1	P36775	1133 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PEX32	P38292	413 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YML037C	Q03703	340 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PPM1	Q04081	328 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	BUD14	P27637	709 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	THI2	P38141	450 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SFB3	P38810	929 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	FKH1	P40466	484 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	INA22	P40576	216 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	BIT61	P47041	543 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TWF1	P53250	332 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SGO1	Q08490	590 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SEC66	P33754	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	LRO1	P40345	661 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	EFM3	P47163	339 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	AQR1	P53943	586 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	VPS20	Q04272	221 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	VTA1	Q06263	330 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	AVL9	Q12500	764 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TPK2	P06245	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RFC3	P38629	340 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	STB5	P38699	743 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YHR078W	P38799	552 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CTF8	P38877	133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SAK1	P38990	1142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	AKR1	P39010	764 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GIP4	P39732	760 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	REC102	Q02721	264 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	STP3	Q05937	343 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	GAL80	P04387	435 aa		4.21	□□□□□ -1.73

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