RNA–Protein interactions for RNA: YDR319C

YFT2, Transcript of Protein required for normal ER membrane biosynthesis, yeast

Gene YFT2, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YFT2	YDR319C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	TAM41	P53230	385 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	CSI1	Q04368	295 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	AHC1	Q12433	566 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	SIP1	P32578	815 aa		5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	FTH1	P38310	465 aa		5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	XBP1	P40489	647 aa		5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	TRS130	Q03660	1102 aa		5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	YCL049C	P25577	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	GSH1	P32477	678 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	RGT1	P32862	1170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	HES1	P35843	434 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	IES5	P40060	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	CIN1	P40987	1014 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	SNO3	P43544	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	YGR079W	P53249	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	RSC9	Q03124	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	TPO3	Q06451	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	CDC45	Q08032	650 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	COX1	P00401	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	DBF20	P32328	564 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	NPR3	P38742	1146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	UBP7	P40453	1071 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	AAT1	Q01802	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	MTF2	P10849	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	SNF3	P10870	884 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	LAC1	P28496	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	GEX2	P36173	615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	SKP2	P42843	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	SOL4	P53315	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	YML037C	Q03703	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	TFC6	Q06339	672 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	ATG23	Q06671	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YFT2	YDR319C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PRE8	P23639	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PTP1	P25044	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PTC6	P25646	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PTH2	P34222	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ERV46	P39727	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ERR3	P42222	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	IRC7	P43623	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	IRC8	P47046	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	MSY1	P48527	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	MLC1	P53141	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	RTS3	P53289	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	BLS1	Q06071	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	EXO84	P38261	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PES4	P39684	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PHM8	P40025	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ZAP1	P47043	880 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ATG16	Q03818	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	BAG7	Q12128	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	RTP1	Q12751	981 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PDR18	P53756	1333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	FLO1	P32768	1537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	DJP1	P40564	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	SLD5	Q03406	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	NUC1	P08466	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	VPS45	P38932	577 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	SAP185	P40856	1058 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	UBX6	P47049	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	LSB1	P53281	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YFT2	YDR319C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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