RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YIL166CP40445 542 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W IMO32P53219 342 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W GTB1Q04924 702 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W AFT2Q08957 416 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RPO26P20435 155 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SAT4P25333 603 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RER1P25560 188 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W GDA1P32621 518 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W UGP1P32861 499 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W AXL2P38928 823 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W PAC2P39937 518 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YFL015CP43578 164 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W UBP16Q02863 499 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SDH5Q08230 162 aa4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W GUK1P15454 187 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YMC1P32331 307 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MCM10P32354 571 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W CBF2P32504 956 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SAC6P32599 642 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SLC1P33333 303 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YER010CP40011 234 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W LAS21P40367 830 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TDA10P42938 290 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ZAP1P47043 880 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MEP3P53390 489 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W HOT1Q03213 719 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RAD33Q04231 177 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W VPS38Q05919 439 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W COX17Q12287 69 aa4.95□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W LNP1P38878 278 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W FCP1Q03254 732 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SLM3Q12093 417 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MRPL9P31334 269 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ADE17P38009 592 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SPT8P38915 602 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data4.94□□□□□ -1.62not detected
PRD1YCL057W SKP2P42843 763 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MIC19P43594 170 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W BOP3P53958 396 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ULA1Q12059 462 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ATG9Q12142 997 aa4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TPK1P06244 397 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RAD1P06777 1100 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-FP0CX61 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-GR2P0CX62 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-CP25383 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W AAD3P25612 363 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RPT3P33298 428 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MUD2P36084 527 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ERC1P38767 581 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W SMF1P38925 575 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W COG1P53079 417 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MAL13P53338 473 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ALF1P53904 254 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-DR2Q03483 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W HRD3Q05787 833 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-BQ12260 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-OR2Q12293 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-DR1Q12392 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-OR1Q12439 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TY2A-DR3Q99303 438 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YMR084WA2P2R3 262 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ATP2P00830 511 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YML003WP0CF16 290 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RAD16P31244 790 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YEL043WP32618 956 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W PXL1P36166 706 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W UME6P39001 836 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W EXO1P39875 702 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W OPT1P40897 799 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W STP3Q05937 343 aa4.93□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W LRE1P25579 583 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W ADY2P25613 283 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YET1P35723 206 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W TEF4P36008 412 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W BYE1P36106 594 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W MTG2P38860 518 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W YJR079WP47126 109 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W COG2P53271 262 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W VPS72Q03388 795 aa4.92□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data4.91□□□□□ -1.62not detected
PRD1YCL057W SRP54P20424 541 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W VPS1P21576 704 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PRD1YCL057W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms