RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PTC6	P25646	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	SHC1	P39000	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YJL107C	P42947	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	INM2	Q05533	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YCR043C	P25361	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	SDS22	P36047	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	ERC1	P38767	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	UBP7	P40453	1071 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YIL152W	P40455	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	RIM20	Q12033	661 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	FLO1	P32768	1537 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PDE1	P22434	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	IMA5	P40884	581 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YFH7	P43591	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	NPA3	P47122	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	MLH2	Q07980	695 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	FLO11	P08640	1367 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	CYB2	P00175	591 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	ADH4	P10127	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	GRX7	P38068	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	ARN1	P38731	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	YIL169C	P40442	995 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	GRS2	Q06817	618 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	CRD1	Q07560	283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	NDD1	Q08887	554 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SLX1	YBR228W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	SNF3	P10870	884 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	OPI1	P21957	404 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	MSM1	P22438	575 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	NIC96	P34077	839 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	STV1	P37296	890 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YLF2	P38746	405 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	MET30	P39014	640 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	SWD1	P39706	426 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YIR014W	P40570	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	GSH2	Q08220	491 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	TAH18	Q12181	623 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	LAC1	P28496	418 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	SAD1	P43589	448 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	UBX6	P47049	396 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	VPS25	P47142	202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	VPS4	P52917	437 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	AIM6	Q07716	390 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	AAD4	Q07747	329 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	NRT1	Q08485	598 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	MYO1	P08964	1928 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	COX1	P00401	534 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	COQ1	P18900	473 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	ASK10	P48361	1146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YPR003C	P53394	754 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
SLX1	YBR228W	PDR8	Q06149	701 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
SLX1	YBR228W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YGR079W	P53249	370 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YGR117C	P53270	476 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	RTS1	P38903	757 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	SPO22	P40511	975 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	ICL2	Q12031	575 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SLX1	YBR228W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	PCT1	P13259	424 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	PEP3	P27801	918 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	IMP2'	P32351	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	OCT1	P35999	772 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	OPY1	P38271	328 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MCH4	Q08268	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CBP1	P07252	654 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MYO3	P36006	1272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	VID27	P40157	782 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CDC1	P40986	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YGL260W	P53056	76 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	IZH1	Q03419	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	RAD61	Q99359	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YCR006C	P25350	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms