RNA–Protein interactions for RNA: YOR299W

BUD7, Transcript of Member of the ChAPs family (Chs5p-Arf1p-binding proteins), yeast

Gene BUD7, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD7	YOR299W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HRD3	Q05787	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ECI1	Q05871	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	THI20	Q08224	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	DDC1	Q08949	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	EMP46	Q12396	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SPO21	Q12411	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CNS1	P33313	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ECM13	P38195	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ARG2	P40360	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YIL054W	P40524	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CDC1	P40986	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ASG7	P46993	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RPC17	P47076	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	BRO1	P48582	844 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ECM9	Q02202	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	UFO1	Q04511	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	THI7	Q05998	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ATG33	Q06485	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PSR1	Q07800	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SPE1	P08432	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	KAR3	P17119	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SFB3	P38810	929 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SMF1	P38925	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	EMP65	P40085	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GYP8	P43570	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AIM14	P53109	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	VTI1	Q04338	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RSC3	Q06639	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CCH1	P50077	2039 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SAC7	P17121	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PHO81	P17442	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RAD16	P31244	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AFR1	P33304	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YKL077W	P36081	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HSL7	P38274	827 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YBR225W	P38321	900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	END3	P39013	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PRM9	P39551	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MOB1	P40484	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MAF1	P41910	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SLD3	P53135	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HER2	Q03557	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	GRX8	Q05926	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AAD4	Q07747	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	THI21	Q08975	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	HOG1	P32485	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ADD66	P36040	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SIF2	P38262	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YHR131C	P38835	850 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NUP60	P39705	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	AVT2	P39981	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NCE103	P53615	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YNR063W	P53749	607 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GYL1	Q04322	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PEX15	Q08215	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	AIM41	Q12032	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	LCB4	Q12246	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SAN1	P22470	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	PEX2	P32800	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YBR056W	P38081	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	KHA1	P40309	873 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	RTT101	P47050	842 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	GCV1	P48015	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YML6	P51998	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	SVS1	Q12254	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD7	YOR299W	ARP7	Q12406	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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