RNA–Protein interactions for RNA: YNL233W

BNI4, Transcript of Targeting subunit for Glc7p protein phosphatase, yeast

Gene BNI4, Length 2,679 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BNI4	YNL233W	FRE5	Q08908	694 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	HMI1	Q12039	706 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	AVL9	Q12500	764 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CTF3	Q12748	733 aa		3.13	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CLC1	P17891	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	EMC1	P25574	760 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CCT6	P39079	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ATF1	P40353	525 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MRPS35	P53292	345 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	HST1	P53685	503 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TOF1	P53840	1238 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YNL058C	P53947	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	PLB2	Q03674	706 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RPO31	P04051	1460 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ERV1	P27882	189 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CMC1	P36064	111 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SIF2	P38262	535 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	FMO1	P38866	432 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	REV7	P38927	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
BNI4	YNL233W	FKH2	P41813	862 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CTK2	P46962	323 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CTR1	P49573	406 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YGR035C	P53222	116 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TDA6	Q06466	467 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	GAL80	P04387	435 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	VMA16	P23968	213 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	GYP6	P32806	458 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	DAD2	P36162	133 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YHR218W	P38899	603 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YIR042C	P40586	236 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	BAP3	P41815	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MAF1	P41910	395 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	PET130	P47065	347 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TWF1	P53250	332 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MAK10	Q02197	733 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	INA17	Q02888	182 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YAP6	Q03935	383 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ISN1	Q99312	450 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SDH8	P38345	138 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YGR079W	P53249	370 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	VPS62	P53285	467 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	BOP3	P53958	396 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	ORC3	P54790	616 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	VTA1	Q06263	330 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RXT3	Q07458	294 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MLH2	Q07980	695 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.11	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	PMT1	P33775	817 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	LTV1	P34078	463 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	HEL1	P36113	551 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	RTT105	P40063	208 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	PKP1	P40530	394 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	HXT14	P42833	540 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	AMA1	P50082	593 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	IMO32	P53219	342 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YGR111W	P53265	400 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SNO2	P53823	222 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	USA1	Q03714	838 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	SOV1	Q04748	898 aa		3.1	□□□□□ -1.91
BNI4	YNL233W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.1	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.3 ms