RNA–Protein interactions for RNA: YLR169W

YLR169W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLR169W, Length 354 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR169W	YLR169W	YNL234W	P53857	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	YNL181W	P53878	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	SPO16	P17122	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	TOM20	P35180	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	YBR138C	P38277	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	PUG1	P40100	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	IML2	P47031	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YLR169W	YLR169W	LHS1	P36016	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	MRX1	P40050	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	ASI1	P54074	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	MCP2	Q06567	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	STE50	P25344	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	EXO84	P38261	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	LEU5	P38702	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	HNM1	P19807	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	EFM2	P38347	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	ARP10	Q04549	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	SCW10	Q04951	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	CRN1	Q06440	651 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR169W	YLR169W	ATP4	P05626	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CHO1	P08456	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CDC23	P16522	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	MGR1	P25573	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RAD24	P32641	659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	GEX2	P36173	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	MRPL36	P36531	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YPK3	P38070	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	TIP41	Q12199	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	NYV1	Q12255	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	PET111	P08468	800 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	PHO81	P17442	1178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	PDR3	P33200	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YHL041W	P38730	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	SGF73	P53165	657 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RAP1	P11938	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CTK2	P46962	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	ATG27	P46989	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CUL3	P53202	744 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	SMA1	Q02651	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RTT103	Q05543	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	NPR3	P38742	1146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	PSF2	P40359	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	ASE1	P50275	885 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CRZ1	P53968	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	TRS65	P32893	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	STV1	P37296	890 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	YJL070C	P40361	888 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	IAH1	P41734	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RSM28	Q03430	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RSF1	Q05043	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	COX17	Q12287	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RPB8	P20436	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	EKI1	Q03764	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLR169W	YLR169W	BAR1	P12630	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TFC3	P34111	1160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	ECM10	P39987	644 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	SWP82	P43554	623 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	COG1	P53079	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	YTP1	P53584	459 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	FCP1	Q03254	732 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TMA16	Q08687	178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	EDE1	P34216	1381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TPK1	P06244	397 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	CLB2	P24869	491 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	HXT9	P40885	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	RTS2	P40962	232 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	BSC1	Q12140	328 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLR169W	YLR169W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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