RNA–Protein interactions for RNA: YHR128W

FUR1, Transcript of Uracil phosphoribosyltransferase, yeast

Gene FUR1, Length 651 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FUR1	YHR128W	YMC2	P38087	329 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
FUR1	YHR128W	RKM3	P38222	552 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YBR053C	P38235	358 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YBR225W	P38321	900 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RTT107	P38850	1070 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SPT8	P38915	602 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YEL075C	P39972	122 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ATF1	P40353	525 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	BFA1	P47113	574 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ASI2	P53895	289 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YHM2	Q04013	314 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	TAF10	Q12030	206 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	BI2	P03873	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	TOP3	P13099	656 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SGF29	P25554	259 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	VFA1	P40080	203 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NIT3	P49954	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RSC1	P53236	928 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	UME1	Q03010	460 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	CRR1	Q05790	422 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	DDC1	Q08949	612 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NBP2	Q12163	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	CAN1	P04817	590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PHO13	P19881	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SAP190	P36123	1033 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NUP60	P39705	539 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PZF1	P39933	429 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	GUF1	P46943	645 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YNL144C	P53907	740 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NSE5	Q03718	556 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ARO80	Q04052	950 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	HRD3	Q05787	833 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	EMP46	Q12396	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	UBR1	P19812	1950 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	JIP3	O13555	125 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SPO12	P17123	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	THI4	P32318	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NGG1	P32494	702 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	GYP6	P32806	458 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NIP100	P33420	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	MRPL10	P36520	322 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	MED6	P38782	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SAK1	P38990	1142 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	IES1	P43579	692 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RMD8	P43620	662 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YJL163C	P46996	555 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SSY5	P47002	699 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ALG12	P53730	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	UGO1	Q03327	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	TAF9	Q05027	157 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	NSE1	Q07913	336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	REV1	P12689	985 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YCL002C	P25565	263 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SWE1	P32944	819 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YER189W	P40104	122 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	AMA1	P50082	593 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	COQ6	P53318	479 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YNR061C	P53747	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	VPS75	P53853	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PIR3	Q03180	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	SIL1	Q08199	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	ATG9	Q12142	997 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FUR1	YHR128W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
FUR1	YHR128W	PUT4	P15380	627 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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