RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	YBR071W	P38243	211 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	LEU5	P38702	357 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	RSF1	Q05043	376 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	DAP1	Q12091	152 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	REV1	P12689	985 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	SAN1	P22470	610 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PTH2	P34222	208 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	MSY1	P48527	492 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	SMA1	Q02651	245 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PPT2	Q12036	173 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	BAG7	Q12128	409 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	BLI1	P35727	113 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	JNM1	P36224	373 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	IAH1	P41734	238 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	ADH4	P10127	382 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	BUD14	P27637	709 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PDR3	P33200	976 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	SWD1	P39706	426 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	ARP10	Q04549	284 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PHM6	Q05637	104 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PSR2	Q07949	397 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	ERP4	Q12450	207 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	TMA17	Q12513	150 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	DJP1	P40564	432 aa		4.3	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	YIR014W	P40570	242 aa		4.3	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	KRE9	P39005	276 aa		4.29	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	AZF1	P41696	914 aa		4.29	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	HIF1	Q12373	385 aa		4.29	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	RTP1	Q12751	981 aa		4.29	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	INH1	P01097	85 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	CBS2	P14905	389 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	YHR218W	P38899	603 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	FAA2	P39518	744 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	IMA5	P40884	581 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	SHE10	P53075	577 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	UBX4	P54730	416 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	BSC1	Q12140	328 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEM1	YHR004C	SSH4	P32343	579 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	TFC3	P34111	1160 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	VID27	P40157	782 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ASI1	P54074	624 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ATG23	Q06671	453 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ICL2	Q12031	575 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	URK1	P27515	501 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	TLG2	Q08144	397 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	IES5	P40060	125 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	CAB2	P40506	365 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	SRB7	P47822	140 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ASK10	P48361	1146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	PEX14	P53112	341 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ATG21	Q02887	496 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	PCT1	P13259	424 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	STE50	P25344	346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	PTP2	P29461	750 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	RTS2	P40962	232 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	YJR120W	P47157	116 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	EKI1	Q03764	534 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	SPC19	Q03954	165 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	RRI2	Q12348	645 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	YKL133C	P36066	463 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	AVT5	P38176	459 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ADD37	Q03233	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	PFA5	Q03289	374 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	SGF73	P53165	657 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	COG6	P53959	839 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	GLN3	P18494	730 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	OPI1	P21957	404 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	TFC4	P33339	1025 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	MDM31	P38880	579 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	BUD16	P39988	312 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	ARP7	Q12406	477 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NEM1	YHR004C	MPD2	Q99316	277 aa		4.21	□□□□□ -1.73

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