RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YER186CP40101 306 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PCL7P40186 285 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YJR061WP40355 935 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W JEM1P40358 645 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YJL049WP47048 450 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W KAP114P53067 1004 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PEF1P53238 335 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W COG2P53271 262 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SLT2Q00772 484 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ABZ2Q03266 374 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W TAF12Q03761 539 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PIG1Q06216 648 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YPD1Q07688 167 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YLR031WQ07978 186 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YOR378WQ08902 515 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RSA1Q08932 381 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MLH3Q12083 715 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W REX3Q12090 404 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W AUS1Q08409 1394 aa3.51□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MLP2P40457 1679 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARG81P05085 880 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RAD4P14736 754 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W NUP1P20676 1076 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SPE2P21182 396 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PEX1P24004 1043 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W HSP30P25619 332 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W FUB1P25659 250 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ZIP1P31111 875 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W TFB1P32776 642 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GMH1P36125 273 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MRPL17P36528 281 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W APT2P36973 181 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W FES1P38260 290 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PEX32P38292 413 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YMR262WP38430 313 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YHI9P38765 294 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W EDC3P39998 551 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W IES5P40060 125 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W COX16P47081 118 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ABM1P47146 123 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CGR1P53188 120 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W LSB1P53281 241 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W BSC5P53755 489 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GOR1P53839 350 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CWC25P53854 179 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RMI1Q02685 241 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SWP1Q02795 286 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W KAP120Q02932 1032 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W FCP1Q03254 732 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W FIN1Q03898 291 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SND1Q04007 877 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PDS5Q04264 1277 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SPC24Q04477 213 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARP9Q05123 467 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W USV1Q12132 391 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W AHC1Q12433 566 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YOR131CQ12486 218 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SEY1Q99287 776 aa3.5□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RPP0P05317 312 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W STE3P06783 470 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YMR085WP0CF18 432 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PUT4P15380 627 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
VFA1YER128W THR1P17423 357 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SFL1P20134 766 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DBP3P20447 523 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PHO3P24031 467 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W KCC4P25389 1037 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SSH4P32343 579 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W OCT1P35999 772 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W CAF4P36130 643 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W KAP104P38217 918 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SWC5P38326 303 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W MSG5P38590 489 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SMF2P38778 549 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W VPS45P38932 577 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YEN1P40028 759 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W NDE1P40215 560 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YTA12P40341 825 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W PKP1P40530 394 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W YIL001WP40560 513 aa3.49□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ZIM17P42844 174 aa3.49□□□□□ -1.85
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