RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	ERS1	P17261	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ERG8	P24521	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PHO91	P27514	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GSM1	P42950	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	EXG2	P52911	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	VPS4	P52917	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TAP42	Q04372	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RRT8	Q08219	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	HOS1	Q12214	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	VCX1	Q99385	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PDR10	P51533	1564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SOD2	P00447	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YSC84	P32793	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YPT7	P32939	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	UBP11	P36026	717 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YBL028C	P38202	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YHR054C	P38780	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GID8	P40208	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SOV1	Q04748	898 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	XYL2	Q07993	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	UPC2	Q12151	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	AFT1	P22149	690 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GRR1	P24814	1151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	NTG1	P31378	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CAB3	P36076	571 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ALY1	P36117	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CDS1	P38221	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	VID24	P38263	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	EPL1	P43572	832 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MET12	P46151	657 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TAF4	P50105	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YBT1	P32386	1661 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CAT8	P39113	1433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SRB2	P34162	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YUH1	P35127	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GEX2	P36173	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CCL1	P37366	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YHR033W	P38690	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	THI22	Q06490	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	AIM6	Q07716	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CTF3	Q12748	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	FBP1	P09201	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MER1	P16523	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CCT6	P39079	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	JHD1	P40034	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PKP1	P40530	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YDL183C	P48569	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MLC1	P53141	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ARP5	P53946	755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ATG21	Q02887	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MUB1	Q03162	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ECM18	Q04623	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YEH1	Q07804	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PRE4	P30657	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SPC110	P32380	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
TYW1	YPL207W	YIR007W	P40566	764 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ASM4	Q05166	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MSC3	Q05812	728 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SWT1	Q12104	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	BUD3	P25558	1636 aa		4.59	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
TYW1	YPL207W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PET127	P32606	800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LTV1	P34078	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PIM1	P36775	1133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	APN2	P38207	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms