RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	PRR1	P28708	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	STE13	P33894	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	HEL1	P36113	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	YER186C	P40101	306 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	ZAP1	P47043	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	TPO2	P53283	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	VPS9	P54787	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	CTF3	Q12748	733 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	IZH4	Q99393	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	BAS1	P22035	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	VPS3	P23643	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	URA10	P30402	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	ETR1	P38071	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	AIM18	P38884	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	ALT2	P52892	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	NNF2	P53253	936 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	FMN1	Q03778	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RKM2	Q03942	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	THI20	Q08224	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	VPS54	Q12071	889 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	EMP46	Q12396	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RTP1	Q12751	981 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD22	YMR014W	RAD3	P06839	778 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	EXO70	P19658	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GAC1	P28006	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HEM3	P28789	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	FUI1	P38196	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PPX1	P38698	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SHU2	P38957	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YJL107C	P42947	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YJL132W	P47014	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RSM26	P47141	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GRX8	Q05926	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ADY3	Q07732	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AAD15	Q08361	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	GNT1	Q12096	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PNS1	Q12412	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AMD2	P22580	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TSR4	P25040	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AAD3	P25612	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MSH2	P25847	964 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	FRE1	P32791	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SEC6	P32844	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SWH1	P35845	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	RFC3	P38629	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PRM9	P39551	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	ERR3	P42222	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MDJ2	P42834	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	YNL144C	P53907	740 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TFB2	Q02939	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	TAF11	Q04226	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	AAD4	Q07747	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	NRT1	Q08485	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SEC39	Q12745	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
BUD22	YMR014W	GAL80	P04387	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	FUB1	P25659	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	MET4	P32389	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	SMI1	P32566	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	BEM3	P32873	1128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	APN2	P38207	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	HSL7	P38274	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BUD22	YMR014W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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