RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	GTB1	Q04924	702 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RSF1	Q05043	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CRR1	Q05790	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	BIK1	P11709	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CWH43	P25618	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NUF2	P33895	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RSM22	P36056	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YER010C	P40011	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TED1	P40533	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CTF18	P49956	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SGF73	P53165	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SPO19	Q03029	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
LEU1	YGL009C	TRM8	Q12009	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NUC1	P08466	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SAC7	P17121	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	LYS5	P50113	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ASE1	P50275	885 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RET3	P53600	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MNT4	P53745	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VPS60	Q03390	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	BNR1	P40450	1375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	DAL81	P21657	970 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GRR1	P24814	1151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MDL2	P33311	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	FLR1	P38124	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	BNA6	P43619	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TIM50	Q02776	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RMT2	Q03305	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GIS4	Q04233	774 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SPH1	Q06160	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ABM1	P47146	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YGL242C	P53066	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CBK1	P53894	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	IVY1	Q04934	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MCH5	Q08777	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	GIS3	Q12418	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ISA2	Q12425	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PHO5	P00635	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CDC42	P19073	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
LEU1	YGL009C	PRD1	P25375	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MRPL40	P36534	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	IFA38	P38286	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	PIK1	P39104	1066 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YEL076C	P39971	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MAD2	P40958	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CUZ1	P53899	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CIK1	Q01649	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	URC2	Q04411	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TGS1	Q12052	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	VPS54	Q12071	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	RBD2	Q12270	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LEU1	YGL009C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64

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