RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W CDC123Q05791 360 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YLR053CQ12026 108 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W REV1P12689 985 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W CDC10P25342 322 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YHI9P38765 294 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W MEF2P39677 819 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LIA1P47120 325 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W BUD32P53323 261 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W CDC14Q00684 551 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TOF2Q02208 771 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W NHX1Q04121 633 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SGO1Q08490 590 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W RMD5Q12508 421 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YLR149CQ99296 730 aa8.99□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ENO1P00924 437 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ERG20P08524 352 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W MRPL8P22353 238 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W MCM5P29496 775 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W CYM1P32898 989 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PEX5P35056 612 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ALY1P36117 915 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TGL4P36165 910 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TUB4P53378 473 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W NUP100Q02629 959 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W NSE5Q03718 556 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W RSC2Q06488 889 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W VHS3Q08438 674 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W KCS1Q12494 1050 aa8.98□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ATP12P22135 325 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SEC14P24280 304 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YHL041WP38730 149 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W EXO1P39875 702 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SSP120P39931 234 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W HEM14P40012 539 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PEP8P40335 379 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YGL140CP53120 1219 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W DOS2P54858 310 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TRS31Q03337 283 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SEG1Q04279 960 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TMN2Q04562 672 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LDB18Q07887 179 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PEX15Q08215 383 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YLR046CQ12253 270 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PEX11Q12462 236 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YMR030W-AQ3E760 96 aa8.97□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YPR117WQ06116 2489 aa8.96□□□□□ -0.97
DDI1YER143W UBR1P19812 1950 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YMR085WP0CF18 432 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SIR1P21691 654 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MIH1P23748 554 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GEX1P25596 615 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MSH2P25847 964 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RIM1P32445 135 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GEX2P36173 615 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MRPL40P36534 297 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RDH54P38086 958 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MRX1P40050 688 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W UBP7P40453 1071 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W IPI3P53877 555 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PIR1Q03178 341 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YML119WQ03208 357 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YMR209CQ03648 457 aa8.96□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GLN4P13188 809 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data8.95□□□□□ -0.98not detected
DDI1YER143W ARF2P19146 181 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W HRR25P29295 494 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W NIP1P32497 812 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SLD2P34252 453 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MRP21P38175 177 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YSW1P38280 609 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W CRP1P38845 465 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W MNN1P39106 762 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YNL058CP53947 316 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W UBX4P54730 416 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W REG1Q00816 1014 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RSC4Q02206 625 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YDR132CQ03900 495 aa8.95□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AMD2P22580 549 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W AEP1P32493 518 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YSC84P32793 468 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SQT1P35184 431 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RIM2P38127 377 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W DUN1P39009 513 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RAD26P40352 1085 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W SAP4P53036 818 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W COG1P53079 417 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W PEX8P53248 589 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W RCF2P53721 224 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W TFB2Q02939 513 aa8.94□□□□□ -0.98
DDI1YER143W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms