RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	TCO89	Q08921	799 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	AVL9	Q12500	764 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	SPS22	P25380	463 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	HMX1	P32339	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ALY1	P36117	915 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	OMA1	P36163	345 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	VID24	P38263	362 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	PEX32	P38292	413 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	JHD1	P40034	492 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YJL070C	P40361	888 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MET28	P40573	187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	LEM3	P42838	414 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	GCV1	P48015	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	PUS2	P53167	370 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YGR045C	P53229	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MDR1	P53258	950 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	HDA1	P53973	706 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ATG21	Q02887	496 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	STP4	Q07351	490 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ICL2	Q12031	575 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	VPS54	Q12071	889 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	CDC42	P19073	191 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ARG1	P22768	420 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ERG8	P24521	451 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	COQ2	P32378	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	KRE6	P32486	720 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPD3	P32561	433 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MRE11	P32829	692 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	SEF1	P34228	1148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	LRO1	P40345	661 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ZAP1	P47043	880 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MTC3	P53077	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YGR111W	P53265	400 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	AQR1	P53943	586 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	SMA1	Q02651	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	PNG1	Q02890	363 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	DCI1	Q08558	271 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	THI21	Q08975	551 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TPK2	P06245	380 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	KAE1	P36132	386 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	APN2	P38207	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RRT2	P38332	387 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	CHS6	P40955	746 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	VPS4	P52917	437 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	HOP2	P53187	214 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MED7	Q08278	222 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	TRE1	Q08919	783 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	UPC2	Q12151	913 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	UBX3	Q12229	455 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	BIK1	P11709	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	UNG1	P12887	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	VPS3	P23643	1011 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	LTV1	P34078	463 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	PXL1	P36166	706 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MAL33	P38157	468 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SLX8	YER116C	MMS4	P38257	691 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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