RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C SNF1P06782 633 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ALG1P16661 449 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRP6P19735 899 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PHO13P19881 312 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DBP3P20447 523 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TRX1P22217 103 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KRE6P32486 720 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LIP5P32875 414 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VAM7P32912 316 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C OMA1P36163 345 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C NAT2P37293 288 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PEX7P39108 375 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ELP2P42935 788 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AIM24P47127 394 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YKE2P52553 114 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YGR125WP53273 1036 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VAC7P53950 1165 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SFB2P53953 876 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPM2Q02773 1202 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FDC1Q03034 503 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TAF12Q03761 539 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SPC19Q03954 165 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SGD1Q06132 899 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MLC2Q06580 163 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C IRC3Q06683 689 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YPD1Q07688 167 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C FMP25Q08023 583 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SSP2Q08646 371 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TMA16Q08687 178 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DSE3Q08729 430 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C BCK1Q01389 1478 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPL25P04456 142 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SAM35P14693 329 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C KTR4P38131 464 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SDH8P38345 138 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AST2P39945 430 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C ALR2P43553 858 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VMA10P48836 114 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TOM22P49334 152 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HER2Q03557 464 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VAC14Q06708 880 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
DOA4YDR069C BAG7Q12128 409 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TAH18Q12181 623 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C EMP46Q12396 444 aa3.23□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CDC8P00572 216 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C HSP60P19882 572 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MBR1P23493 339 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YCR051WP25631 222 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MRPL37P36532 105 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YBL028CP38202 106 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C APE4P38821 490 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YAP1801P38856 637 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C COX16P47081 118 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CGR1P53188 120 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SDH1Q00711 640 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VPS38Q05919 439 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RGA2Q06407 1009 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YPR091CQ06833 770 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C AKR2Q12013 749 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C VPS54Q12071 889 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YLR125WQ12138 136 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YMR084WA2P2R3 262 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPC40P07703 335 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C SNF5P18480 905 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DBP2P24783 546 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PEP3P27801 918 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C DOM34P33309 386 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MYO3P36006 1272 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YKR073CP36153 106 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C YMR262WP38430 313 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C MTG2P38860 518 aa3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C THO1P40040 218 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
DOA4YDR069C CAB2P40506 365 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.2 ms