RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	TOS1	P38288	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	FET5	P43561	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	CUL3	P53202	744 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SNF12	P53628	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YAP6	Q03935	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	BUD7	Q08754	746 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SWM1	Q12379	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	GAL10	P04397	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SEO1	YAL067C	GYP6	P32806	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SWH1	P35845	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	DOT5	P40553	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	GCV2	P49095	1034 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	NCS6	P53088	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YGR066C	P53242	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SEO1	YAL067C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	PSY3	Q12318	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SEC12	P11655	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	PEX1	P24004	1043 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SNT1	P25357	1226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YCR015C	P25616	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	COS111	P38308	924 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YJL193W	P39542	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RTT105	P40063	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	IME4	P41833	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	MET12	P46151	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	MRPS35	P53292	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	TLG1	Q03322	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YML037C	Q03703	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YFT2	Q06676	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	CEX1	Q12453	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	AFI1	Q99222	893 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YCR061W	P25639	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SYN8	P31377	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	AKR1	P39010	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	IDS2	P46958	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	YNR068C	P53754	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SSY1	Q03770	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	SOV1	Q04748	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	HOF1	Q05080	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	APL4	Q12028	832 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	ATG29	Q12092	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEO1	YAL067C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SWC3	P31376	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DSS4	P32601	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RIB7	P33312	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ATF1	P40353	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YIL077C	P40508	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MTL1	P53214	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	HST1	P53685	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MLH2	Q07980	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	TCO89	Q08921	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SWT1	Q12104	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MSP1	P28737	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SRB5	P32585	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	PPQ1	P32945	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	RPP1	P38786	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	VPS41	P38959	992 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	TMN3	P40071	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	CHA4	P43634	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	GAD1	Q04792	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	SEC15	P22224	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	VPS34	P22543	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YEL043W	P32618	956 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	DAD2	P36162	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YHR054C	P38780	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEO1	YAL067C	YJL206C	P39529	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 115.4 ms