RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A GRC3Q07845 632 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A NUR1Q12066 484 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A FRE7Q12333 620 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RIM2P38127 377 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ERC1P38767 581 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YJR096WP47137 282 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PIP2P52960 996 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SGF73P53165 657 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SKY1Q03656 742 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YDL218WQ07629 317 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A NTG2Q08214 380 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GDH1P07262 454 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CBS2P14905 389 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MTF1P14908 341 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GSH1P32477 678 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SEF1P34228 1148 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A UGO1Q03327 502 aa0.59□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A COX1P00401 534 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MYO2P19524 1574 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A BRE5P53741 515 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A PEX25Q02969 394 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YML133CQ03099 1374 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A SWF1Q04629 336 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YLL067CQ07888 1374 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MUM3Q08750 479 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A CIR2Q08822 631 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YLL066CQ99208 1374 aa0.59□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A SSK2P53599 1579 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A HHF1P02309 103 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A AAC1P04710 309 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MTC2P34246 357 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A NPR2P39923 615 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A RTS2P40962 232 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A PFD1P46988 109 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A BSC1Q12140 328 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A CPR1P14832 162 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A VPS33P20795 691 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A ECM32P32644 1121 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MDM31P38880 579 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A FAA2P39518 744 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A AXL1P40851 1208 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A ATG27P46989 271 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YJL132WP47014 750 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YJR120WP47157 116 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A SAP4P53036 818 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A RBG2P53295 368 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A SND1Q04007 877 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A ECM30Q06673 1274 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MLH2Q07980 695 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A TPK1P06244 397 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A RAP1P11938 827 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A RRP43P25359 394 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MSH2P25847 964 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MRPL10P36520 322 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A FTR1P40088 404 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YGR237CP50089 785 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MET13P53128 600 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A NYV1Q12255 253 aa0.58□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A NTE1Q04958 1679 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A IES6P32617 166 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A AFR1P33304 620 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A QRI7P43122 407 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YGL081WP53156 320 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YNL193WP53870 558 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A NGL1Q08213 363 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data0.57□□□□□ -2.32not detected
YPL060C-AYPL060C-A SWH1P35845 1188 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YJL213WP40896 331 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YGR079WP53249 370 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A WSC2P53832 503 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A TDA7P53882 636 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A VTC3Q02725 835 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A ARP10Q04549 284 aa0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A PMS1P14242 873 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YEF3P16521 1044 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A GSY2P27472 705 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A CNS1P33313 385 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YKL097CP34245 136 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A MNN2P38069 597 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A EMP65P40085 556 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A IAH1P41734 238 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A NOP15P53927 220 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A UME1Q03010 460 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A UTP14Q04500 899 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A PSF3Q12146 194 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A VPS5Q92331 675 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A YOR093CQ12275 1648 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A TOP1P04786 769 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A HXK2P04807 486 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A PTC6P25646 442 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A SRO77P38163 1010 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A ICS2P38284 255 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A NCA3P46955 337 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A IKS1P47042 667 aa0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
YPL060C-AYPL060C-A DAP1Q12091 152 aa0.56□□□□□ -2.32
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