RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	SGO1	Q08490	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	PEP5	P12868	1029 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	HEM15	P16622	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	NDI1	P32340	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ADD66	P36040	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MSR1	P38714	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MED6	P38782	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YAT2	P40017	923 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YIR007W	P40566	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	IML2	P47031	731 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	URB2	P47108	1174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	RTA1	P53047	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	TOF2	Q02208	771 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SHR3	Q02774	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	TMN2	Q04562	672 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SWC7	Q06707	132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	FRA1	Q07825	749 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	IMA2	Q08295	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	NRT1	Q08485	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	LDB17	Q12342	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	AVL9	Q12500	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	CDC20	P26309	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ISF1	P32488	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YME1	P32795	747 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ATG12	P38316	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SMF2	P38778	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ERR3	P42222	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YNR063W	P53749	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	RNT1	Q02555	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	INP2	Q03824	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ARP9	Q05123	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SFH1	Q06168	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	OMS1	Q06668	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	PEX15	Q08215	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	COX5A	P00424	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	GID7	P25569	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	URA10	P30402	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	PEX5	P35056	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MRPL40	P36534	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	FUI1	P38196	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YFL012W	P43580	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SCW11	P53189	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YPR003C	P53394	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	REG1	Q00816	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	USA1	Q03714	838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YHM2	Q04013	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SEG1	Q04279	960 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	HPF1	Q05164	967 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	PGC1	Q08959	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	HOS1	Q12214	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	OCA6	Q12454	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MRPL25	P23369	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YCL068C	P25593	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	TGL4	P36165	910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	RDH54	P38086	958 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	CHS6	P40955	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	LSB6	P42951	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	MRX6	P48564	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	HST2	P53686	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SIW14	P53965	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	BET2	P20133	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	DAL81	P21657	970 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	TSR4	P25040	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SGF29	P25554	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	KAR9	P32526	644 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	STE5	P32917	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	SWE1	P32944	819 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	AMA1	P50082	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	GND2	P53319	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAD1	YMR250W	CDC14	Q00684	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms