RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	GUP2	Q08929	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RED1	P14291	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SPO16	P17122	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	AAC3	P18238	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DAL7	P21826	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NPP1	P25353	742 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DAL3	P32459	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	STE14	P32584	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MCD4	P36051	919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YKR018C	P36114	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YRO2	P38079	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	HSL7	P38274	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YEL068C	P39977	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	VAB2	P40003	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YER158C	P40095	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	VHR1	P40522	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ASK10	P48361	1146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ASE1	P50275	885 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PCL10	P53124	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TEP1	P53916	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RSC3	Q06639	885 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PGC1	Q08959	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SFI1	Q12369	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TRM13	Q12383	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CKA2	P19454	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ERG4	P25340	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	GSY2	P27472	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ORC2	P32833	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	BYE1	P36106	594 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	UME6	P39001	836 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	KHA1	P40309	873 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	AXL1	P40851	1208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
MRP4	YHL004W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MRP4	YHL004W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	FMS1	P50264	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MFM1	Q02783	413 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YHM2	Q04013	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TAF11	Q04226	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ISA2	Q12425	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SED4	P25365	1065 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CDC15	P27636	974 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	REC104	P33323	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SDS22	P36047	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MRPL36	P36531	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YHR218W	P38899	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SPC72	P39723	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	UBP7	P40453	1071 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	THI6	P41835	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	GYP8	P43570	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	IRC6	P43615	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	NET1	P47035	1189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	STB4	P50104	949 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	LIF1	P53150	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	VPS9	P54787	451 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YML037C	Q03703	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	NHX1	Q04121	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ATG33	Q06485	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SEM1	O94742	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	HMG1	P12683	1054 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PMS1	P14242	873 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PHO3	P24031	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	RPC82	P32349	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	YIL089W	P40500	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	SAE2	P46946	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP4	YHL004W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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