RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077337.8

Irx1-201, Transcript of Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Irx1, Length 2,373 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1-201ENSMUST00000077337 Chtf8P0CG14 533 aa13,36□□□□□ -0,27
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb11Q8R2I7 77 aa13,36□□□□□ -0,27
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap14O08640 167 aa13,36□□□□□ -0,27
Irx1-201ENSMUST00000077337 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP13,35□□□□□ -0,27
Irx1-201ENSMUST00000077337 Tnp2P11378 117 aa13,31□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb39Q70KL3 74 aa13,31□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa13,3□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Mrpl55Q9CZ83 127 aa13,3□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb38Q7TNV7 63 aa13,29□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Hectd4E9Q2E4 4418 aa13,29□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10337F7DEP7 55 aa13,28□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm28374F6SG70 93 aa13,28□□□□□ -0,28
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm16253D3Z167 63 aa13,27□□□□□ -0,29
Irx1-201ENSMUST00000077337 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa13,24□□□□□ -0,29
Irx1-201ENSMUST00000077337 Stard9Q80TF6 4561 aa13,23□□□□□ -0,29
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ccdc179J3QM76 67 aa13,19□□□□□ -0,3
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pkd1O08852 4293 aa13,18□□□□□ -0,3
Irx1-201ENSMUST00000077337 Bean1Q9EQG5 255 aa13,16□□□□□ -0,3
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10160F6Y577 67 aa13,16□□□□□ -0,3
Irx1-201ENSMUST00000077337 Vps13dB1ART2 4390 aa13,16□□□□□ -0,3
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah2P0C6F1 4456 aa13,14□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap13O88375 197 aa13,13□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 H2al1bA0A087WP11 105 aa13,12□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 H2al1kJ3QP08 105 aa13,12□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 H2al1eQ810S6 105 aa13,12□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 H2al1mQ9DAD9 105 aa13,12□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa13,1□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 Phxr4P15974 95 aa13,09□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 Spaca4Q80ZQ0 127 aa13,09□□□□□ -0,31
Irx1-201ENSMUST00000077337 ApobE9Q414 4505 aa13,05□□□□□ -0,32
Irx1-201ENSMUST00000077337 Lrp1bQ9JI18 4599 aa13,05□□□□□ -0,32
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm2696A0A1W2P709 240 aa13,02□□□□□ -0,33
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb13Q8R2I4 64 aa13□□□□□ -0,33
Irx1-201ENSMUST00000077337 Cypt15B1AXS0 87 aa12,99□□□□□ -0,33
Irx1-201ENSMUST00000077337 Wfdc3Q14AE4 130 aa12,98□□□□□ -0,33
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm21798J3QNU5 87 aa12,92□□□□□ -0,34
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm20661K7N787 53 aa12,92□□□□□ -0,34
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pkhd1E9PZ36 4059 aa12,91□□□□□ -0,34
Irx1-201ENSMUST00000077337 4933415A04RikQ9D443 101 aa12,84□□□□□ -0,35
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa12,73□□□□□ -0,37
Irx1-201ENSMUST00000077337 Sox16Q62247 57 aa12,72□□□□□ -0,37
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10999F6Q4M4 69 aa12,71□□□□□ -0,37
Irx1-201ENSMUST00000077337 SptssbQ925E8 76 aa12,7□□□□□ -0,38
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10643Q3URG9 111 aa12,69□□□□□ -0,38
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fat2Q5F226 4351 aa12,66□□□□□ -0,38
Irx1-201ENSMUST00000077337 OxtP35454 125 aa12,66□□□□□ -0,38
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP12,64□□□□□ -0,39
Irx1-201ENSMUST00000077337 RetnlbQ99P86 105 aa12,6□□□□□ -0,39
Irx1-201ENSMUST00000077337 Q8BGJ3 129 aa12,59□□□□□ -0,39
Irx1-201ENSMUST00000077337 SacsQ9JLC8 4582 aa12,59□□□□□ -0,39
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ndufb1P0DN34 57 aa12,58□□□□□ -0,4
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ryr3A2AGL3 4863 aa12,55□□□□□ -0,4
Irx1-201ENSMUST00000077337 2310034C09RikQ9D746 214 aa12,54□□□□□ -0,4
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb1P56386 69 aa12,49□□□□□ -0,41
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap3-2Q9D638 99 aa12,47□□□□□ -0,41
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa12,47□□□□□ -0,41
Irx1-201ENSMUST00000077337 Uqcr11Q9CPX8 56 aa12,45□□□□□ -0,42
Irx1-201ENSMUST00000077337 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa12,44□□□□□ -0,42
Irx1-201ENSMUST00000077337 Limd2Q8BGB5 128 aa12,42□□□□□ -0,42
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm3646F6S692 53 aa12,36□□□□□ -0,43
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm26620Q9CY65 116 aa12,35□□□□□ -0,43
Irx1-201ENSMUST00000077337 A930033H14RikG5E8X6 103 aa12,3□□□□□ -0,44
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm11939A2A592 99 aa12,29□□□□□ -0,44
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm4491E0CX42 125 aa12,29□□□□□ -0,44
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa12,28□□□□□ -0,44
Irx1-201ENSMUST00000077337 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP12,28□□□□□ -0,44
Irx1-201ENSMUST00000077337 Rps29P62274 56 aa12,23□□□□□ -0,45
Irx1-201ENSMUST00000077337 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa12,23□□□□□ -0,45
Irx1-201ENSMUST00000077337 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa12,19□□□□□ -0,46
Irx1-201ENSMUST00000077337 Vps13bQ80TY5 3993 aa12,19□□□□□ -0,46
Irx1-201ENSMUST00000077337 9230102O04RikA2ASX7 82 aa12,19□□□□□ -0,46
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ndufs5Q99LY9 106 aa12,13□□□□□ -0,47
Irx1-201ENSMUST00000077337 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa12,11□□□□□ -0,47
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP12,09□□□□□ -0,47
Irx1-201ENSMUST00000077337 1700042G07RikB1AUF7 90 aa12,04□□□□□ -0,48
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa11,98□□□□□ -0,49
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap19-5O08632 62 aa11,96□□□□□ -0,49
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa11,92□□□□□ -0,5
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fat3Q8BNA6 4555 aa11,92□□□□□ -0,5
Irx1-201ENSMUST00000077337 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa11,89□□□□□ -0,51
Irx1-201ENSMUST00000077337 Abca13Q5SSE9 5034 aa11,85□□□□□ -0,51
Irx1-201ENSMUST00000077337 Sec61gP60060 68 aa11,82□□□□□ -0,52
Irx1-201ENSMUST00000077337 Cox6b2Q80ZN9 88 aa11,8□□□□□ -0,52
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ryr1E9PZQ0 5035 aa11,79□□□□□ -0,52
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm5965D3Z724 196 aa11,77□□□□□ -0,53
Irx1-201ENSMUST00000077337 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa11,71□□□□□ -0,53
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah8Q91XQ0 4731 aa11,7□□□□□ -0,54
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm20537G3UYK7 97 aa11,63□□□□□ -0,55
Irx1-201ENSMUST00000077337 Rnase13Q5GAM7 153 aa11,62□□□□□ -0,55
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm9821Q8K076 103 aa11,62□□□□□ -0,55
Irx1-201ENSMUST00000077337 Rpl37Q9D823 97 aa11,57□□□□□ -0,56
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa11,51□□□□□ -0,57
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10382Q3V0T5 144 aa11,51□□□□□ -0,57
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pla2g10Q9QXX3 151 aa11,5□□□□□ -0,57
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm17606F6ZL36 78 aa11,41□□□□□ -0,58
Irx1-201ENSMUST00000077337 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa11,34□□□□□ -0,59
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm9955Q8CEJ8 102 aa11,34□□□□□ -0,59
Irx1-201ENSMUST00000077337 Herc2Q4U2R1 4836 aa11,3□□□□□ -0,6
Irx1-201ENSMUST00000077337 HydinQ80W93 5154 aa11,27□□□□□ -0,6
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm17416Q30KP4 66 aa11,27□□□□□ -0,61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48 ms