Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Gm3880A0A1B0GSB3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm3880A0A1B0GSB3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm3880A0A1B0GSB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm3880A0A1B0GSB3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC15,55■□□□□ 0,08
Gm3880A0A1B0GSB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Gm3880A0A1B0GSB3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Gm3880A0A1B0GSB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,3■□□□□ 0,04
Gm3880A0A1B0GSB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
Gm3880A0A1B0GSB3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
Gm3880A0A1B0GSB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC14,95□□□□□ -0,02
Gm3880A0A1B0GSB3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC14,93□□□□□ -0,02
Gm3880A0A1B0GSB3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
Gm3880A0A1B0GSB3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
Gm3880A0A1B0GSB3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Gm3880A0A1B0GSB3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,74□□□□□ -0,05
Gm3880A0A1B0GSB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,72□□□□□ -0,05
Gm3880A0A1B0GSB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC14,69□□□□□ -0,06
Gm3880A0A1B0GSB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,65□□□□□ -0,06
Gm3880A0A1B0GSB3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,63□□□□□ -0,07
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,61□□□□□ -0,07
Gm3880A0A1B0GSB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,6□□□□□ -0,07
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,58□□□□□ -0,08
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,57□□□□□ -0,08
Gm3880A0A1B0GSB3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,56□□□□□ -0,08
Gm3880A0A1B0GSB3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,51□□□□□ -0,09
Gm3880A0A1B0GSB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,47□□□□□ -0,09
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC14,47□□□□□ -0,09
Gm3880A0A1B0GSB3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,43□□□□□ -0,1
Gm3880A0A1B0GSB3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,4□□□□□ -0,1
Gm3880A0A1B0GSB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,39□□□□□ -0,11
Gm3880A0A1B0GSB3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC14,34□□□□□ -0,11
Gm3880A0A1B0GSB3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Gm3880A0A1B0GSB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,13
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14,26□□□□□ -0,13
Gm3880A0A1B0GSB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Gm3880A0A1B0GSB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,22□□□□□ -0,13
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,21□□□□□ -0,13
Gm3880A0A1B0GSB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,19□□□□□ -0,14
Gm3880A0A1B0GSB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,19□□□□□ -0,14
Gm3880A0A1B0GSB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,14□□□□□ -0,15
Gm3880A0A1B0GSB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14,1□□□□□ -0,15
Gm3880A0A1B0GSB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,09□□□□□ -0,15
Gm3880A0A1B0GSB3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,05□□□□□ -0,16
Gm3880A0A1B0GSB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,05□□□□□ -0,16
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,04□□□□□ -0,16
Gm3880A0A1B0GSB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Gm3880A0A1B0GSB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,01□□□□□ -0,17
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,99□□□□□ -0,17
Gm3880A0A1B0GSB3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,96□□□□□ -0,17
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,94□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC13,94□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,94□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC13,92□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13,91□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,9□□□□□ -0,18
Gm3880A0A1B0GSB3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC13,89□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,87□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC13,84□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Gm3880A0A1B0GSB3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,83□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,83□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,78□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Gm3880A0A1B0GSB3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,76□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,74□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,73□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,73□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,72□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,71□□□□□ -0,21
Gm3880A0A1B0GSB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Gm3880A0A1B0GSB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Gm3880A0A1B0GSB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,69□□□□□ -0,22
Gm3880A0A1B0GSB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,68□□□□□ -0,22
Gm3880A0A1B0GSB3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,67□□□□□ -0,22
Gm3880A0A1B0GSB3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,63□□□□□ -0,23
Gm3880A0A1B0GSB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13,62□□□□□ -0,23
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