Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
1700042G07RikB1AUF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
1700042G07RikB1AUF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700042G07RikB1AUF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
1700042G07RikB1AUF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
1700042G07RikB1AUF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
1700042G07RikB1AUF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17,44■□□□□ 0,38
1700042G07RikB1AUF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17,34■□□□□ 0,37
1700042G07RikB1AUF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17,16■□□□□ 0,34
1700042G07RikB1AUF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
1700042G07RikB1AUF7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
1700042G07RikB1AUF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
1700042G07RikB1AUF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
1700042G07RikB1AUF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
1700042G07RikB1AUF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
1700042G07RikB1AUF7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
1700042G07RikB1AUF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
1700042G07RikB1AUF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC16,7■□□□□ 0,26
1700042G07RikB1AUF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16,61■□□□□ 0,25
1700042G07RikB1AUF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
1700042G07RikB1AUF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
1700042G07RikB1AUF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
1700042G07RikB1AUF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16,24■□□□□ 0,19
1700042G07RikB1AUF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16,22■□□□□ 0,19
1700042G07RikB1AUF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
1700042G07RikB1AUF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
1700042G07RikB1AUF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16,05■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC16,04■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
1700042G07RikB1AUF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
1700042G07RikB1AUF7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
1700042G07RikB1AUF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15,91■□□□□ 0,14
1700042G07RikB1AUF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15,91■□□□□ 0,14
1700042G07RikB1AUF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
1700042G07RikB1AUF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
1700042G07RikB1AUF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15,86■□□□□ 0,13
1700042G07RikB1AUF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
1700042G07RikB1AUF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
1700042G07RikB1AUF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
1700042G07RikB1AUF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
1700042G07RikB1AUF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15,74■□□□□ 0,11
1700042G07RikB1AUF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
1700042G07RikB1AUF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15,69■□□□□ 0,1
1700042G07RikB1AUF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15,68■□□□□ 0,1
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
1700042G07RikB1AUF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,62■□□□□ 0,09
1700042G07RikB1AUF7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
1700042G07RikB1AUF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
1700042G07RikB1AUF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
1700042G07RikB1AUF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
1700042G07RikB1AUF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
1700042G07RikB1AUF7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
1700042G07RikB1AUF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,49■□□□□ 0,07
1700042G07RikB1AUF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15,43■□□□□ 0,06
1700042G07RikB1AUF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15,43■□□□□ 0,06
1700042G07RikB1AUF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,37■□□□□ 0,05
1700042G07RikB1AUF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
1700042G07RikB1AUF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
1700042G07RikB1AUF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
1700042G07RikB1AUF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
1700042G07RikB1AUF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15,28■□□□□ 0,04
1700042G07RikB1AUF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15,28■□□□□ 0,04
1700042G07RikB1AUF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15,27■□□□□ 0,04
1700042G07RikB1AUF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
1700042G07RikB1AUF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15,25■□□□□ 0,03
1700042G07RikB1AUF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15,24■□□□□ 0,03
1700042G07RikB1AUF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
1700042G07RikB1AUF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
1700042G07RikB1AUF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
1700042G07RikB1AUF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
1700042G07RikB1AUF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
1700042G07RikB1AUF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15,11■□□□□ 0,01
1700042G07RikB1AUF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
1700042G07RikB1AUF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,09■□□□□ 0,01
1700042G07RikB1AUF7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
1700042G07RikB1AUF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0,01
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
1700042G07RikB1AUF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15,07■□□□□ 0
1700042G07RikB1AUF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
1700042G07RikB1AUF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15,02■□□□□ -0
1700042G07RikB1AUF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15,02□□□□□ -0,01
1700042G07RikB1AUF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
1700042G07RikB1AUF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC14,99□□□□□ -0,01
1700042G07RikB1AUF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14,99□□□□□ -0,01
1700042G07RikB1AUF7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
1700042G07RikB1AUF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14,97□□□□□ -0,01
1700042G07RikB1AUF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,92□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,91□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC14,9□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC14,9□□□□□ -0,02
1700042G07RikB1AUF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,88□□□□□ -0,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms