Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930507D05RikQ8C9C9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930507D05RikQ8C9C9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930507D05RikQ8C9C9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930507D05RikQ8C9C9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930507D05RikQ8C9C9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930507D05RikQ8C9C9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930507D05RikQ8C9C9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930507D05RikQ8C9C9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930507D05RikQ8C9C9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930507D05RikQ8C9C9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930507D05RikQ8C9C9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930507D05RikQ8C9C9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930507D05RikQ8C9C9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930507D05RikQ8C9C9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930507D05RikQ8C9C9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930507D05RikQ8C9C9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930507D05RikQ8C9C9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930507D05RikQ8C9C9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930507D05RikQ8C9C9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930507D05RikQ8C9C9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930507D05RikQ8C9C9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930507D05RikQ8C9C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930507D05RikQ8C9C9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930507D05RikQ8C9C9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930507D05RikQ8C9C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930507D05RikQ8C9C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930507D05RikQ8C9C9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930507D05RikQ8C9C9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930507D05RikQ8C9C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930507D05RikQ8C9C9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930507D05RikQ8C9C9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930507D05RikQ8C9C9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930507D05RikQ8C9C9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930507D05RikQ8C9C9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930507D05RikQ8C9C9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930507D05RikQ8C9C9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930507D05RikQ8C9C9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930507D05RikQ8C9C9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930507D05RikQ8C9C9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930507D05RikQ8C9C9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930507D05RikQ8C9C9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
4930507D05RikQ8C9C9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms