Protein–RNA interactions for Protein: F7DEP7

Gm10337, Predicted gene 10337, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10337F7DEP7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm10337F7DEP7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,65■□□□□ 0,74
Gm10337F7DEP7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Gm10337F7DEP7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,25■□□□□ 0,67
Gm10337F7DEP7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Gm10337F7DEP7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Gm10337F7DEP7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Gm10337F7DEP7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Gm10337F7DEP7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Gm10337F7DEP7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm10337F7DEP7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Gm10337F7DEP7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Gm10337F7DEP7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Gm10337F7DEP7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Gm10337F7DEP7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Gm10337F7DEP7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Gm10337F7DEP7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17,8■□□□□ 0,44
Gm10337F7DEP7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Gm10337F7DEP7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Gm10337F7DEP7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Gm10337F7DEP7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,69■□□□□ 0,42
Gm10337F7DEP7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Gm10337F7DEP7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Gm10337F7DEP7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Gm10337F7DEP7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Gm10337F7DEP7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Gm10337F7DEP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17,46■□□□□ 0,39
Gm10337F7DEP7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Gm10337F7DEP7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Gm10337F7DEP7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Gm10337F7DEP7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,4■□□□□ 0,38
Gm10337F7DEP7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Gm10337F7DEP7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Gm10337F7DEP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Gm10337F7DEP7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Gm10337F7DEP7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17,23■□□□□ 0,35
Gm10337F7DEP7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
Gm10337F7DEP7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Gm10337F7DEP7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Gm10337F7DEP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Gm10337F7DEP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Gm10337F7DEP7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Gm10337F7DEP7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17,02■□□□□ 0,32
Gm10337F7DEP7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Gm10337F7DEP7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Gm10337F7DEP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Gm10337F7DEP7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Gm10337F7DEP7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Gm10337F7DEP7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Gm10337F7DEP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Gm10337F7DEP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Gm10337F7DEP7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Gm10337F7DEP7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Gm10337F7DEP7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Gm10337F7DEP7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Gm10337F7DEP7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Gm10337F7DEP7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16,64■□□□□ 0,25
Gm10337F7DEP7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Gm10337F7DEP7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Gm10337F7DEP7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,25
Gm10337F7DEP7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,58■□□□□ 0,24
Gm10337F7DEP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Gm10337F7DEP7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16,5■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,23
Gm10337F7DEP7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,22
Gm10337F7DEP7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Gm10337F7DEP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Gm10337F7DEP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Gm10337F7DEP7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,39■□□□□ 0,21
Gm10337F7DEP7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Gm10337F7DEP7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,34■□□□□ 0,21
Gm10337F7DEP7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Gm10337F7DEP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Gm10337F7DEP7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Gm10337F7DEP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Gm10337F7DEP7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Gm10337F7DEP7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Gm10337F7DEP7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,24■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm10337F7DEP7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm10337F7DEP7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,6 ms