Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limd2Q8BGB5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd2Q8BGB5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd2Q8BGB5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd2Q8BGB5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd2Q8BGB5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd2Q8BGB5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd2Q8BGB5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Limd2Q8BGB5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Limd2Q8BGB5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd2Q8BGB5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Limd2Q8BGB5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Limd2Q8BGB5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Limd2Q8BGB5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd2Q8BGB5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd2Q8BGB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd2Q8BGB5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd2Q8BGB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Limd2Q8BGB5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd2Q8BGB5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd2Q8BGB5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd2Q8BGB5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Limd2Q8BGB5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd2Q8BGB5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd2Q8BGB5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Limd2Q8BGB5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd2Q8BGB5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd2Q8BGB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd2Q8BGB5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limd2Q8BGB5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Limd2Q8BGB5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Limd2Q8BGB5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd2Q8BGB5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd2Q8BGB5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limd2Q8BGB5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limd2Q8BGB5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd2Q8BGB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd2Q8BGB5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd2Q8BGB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd2Q8BGB5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd2Q8BGB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd2Q8BGB5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Limd2Q8BGB5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd2Q8BGB5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limd2Q8BGB5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Limd2Q8BGB5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd2Q8BGB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Limd2Q8BGB5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd2Q8BGB5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Limd2Q8BGB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd2Q8BGB5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms