RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077337.8

Irx1-201, Transcript of Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Irx1, Length 2,373 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1-201ENSMUST00000077337 NischQ80TM9 1593 aa43,48■■■■■ 4,55
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Sycp2Q9CUU3 1500 aa36,62■■■■□ 3,45
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP35,07■■■■□ 3,2
Irx1-201ENSMUST00000077337 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34,95■■■■□ 3,19
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Fmn1Q05860 1466 aa34,58■■■■□ 3,13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP34,48■■■■□ 3,11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa34,46■■■■□ 3,11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Mier1Q5UAK0 511 aa34,42■■■■□ 3,1
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP34,34■■■■□ 3,09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Cep162Q6ZQ06 1403 aa34,19■■■■□ 3,06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Myt1lP97500 1187 aa34,17■■■■□ 3,06
Irx1-201ENSMUST00000077337 NefmP08553 848 aa34,14■■■■□ 3,06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Zeb1Q64318 1117 aa34,14■■■■□ 3,06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP34,14■■■■□ 3,06
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Irx1-201ENSMUST00000077337 TnnQ80Z71 1560 aa34,01■■■■□ 3,04
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Arhgap35Q91YM2 1499 aa33,64■■■□□ 2,98
Irx1-201ENSMUST00000077337 Kif15Q6P9L6 1387 aa33,63■■■□□ 2,97
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33,62■■■□□ 2,97
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Irx1-201ENSMUST00000077337 NrkQ9R0G8 1455 aa33,53■■■□□ 2,96
Irx1-201ENSMUST00000077337 Camsap1A2AHC3 1581 aa33,49■■■□□ 2,95
Irx1-201ENSMUST00000077337 Shroom4Q1W617 1475 aa33,42■■■□□ 2,94
Irx1-201ENSMUST00000077337 Arap1Q4LDD4 1452 aa33,37■■■□□ 2,93
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa33,33■■■□□ 2,93
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Neurod1Q60867 357 aa33,29■■■□□ 2,92
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Wdr66E9Q743 1299 aa33,25■■■□□ 2,91
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Map3k1P53349 1493 aa33,22■■■□□ 2,91
Irx1-201ENSMUST00000077337 Setd5Q5XJV7 1441 aa33,21■■■□□ 2,91
Irx1-201ENSMUST00000077337 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa33,19■■■□□ 2,9
Irx1-201ENSMUST00000077337 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa33,09■■■□□ 2,89
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Irx1-201ENSMUST00000077337 Pcf11G3X9Z4 1553 aa32,88■■■□□ 2,85
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