Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm9955Q8CEJ8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9955Q8CEJ8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9955Q8CEJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9955Q8CEJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9955Q8CEJ8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9955Q8CEJ8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9955Q8CEJ8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9955Q8CEJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9955Q8CEJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm9955Q8CEJ8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9955Q8CEJ8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9955Q8CEJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9955Q8CEJ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9955Q8CEJ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9955Q8CEJ8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9955Q8CEJ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9955Q8CEJ8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9955Q8CEJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm9955Q8CEJ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm9955Q8CEJ8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm9955Q8CEJ8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm9955Q8CEJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm9955Q8CEJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9955Q8CEJ8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9955Q8CEJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9955Q8CEJ8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9955Q8CEJ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9955Q8CEJ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9955Q8CEJ8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9955Q8CEJ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm9955Q8CEJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm9955Q8CEJ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm9955Q8CEJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm9955Q8CEJ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm9955Q8CEJ8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm9955Q8CEJ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm9955Q8CEJ8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm9955Q8CEJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm9955Q8CEJ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm9955Q8CEJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm9955Q8CEJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm9955Q8CEJ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm9955Q8CEJ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm9955Q8CEJ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm9955Q8CEJ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm9955Q8CEJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm9955Q8CEJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm9955Q8CEJ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm9955Q8CEJ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm9955Q8CEJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm9955Q8CEJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm9955Q8CEJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm9955Q8CEJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9955Q8CEJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9955Q8CEJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9955Q8CEJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9955Q8CEJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm9955Q8CEJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm9955Q8CEJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm9955Q8CEJ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm9955Q8CEJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm9955Q8CEJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm9955Q8CEJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm9955Q8CEJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm9955Q8CEJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm9955Q8CEJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm9955Q8CEJ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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