Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SptssbQ925E8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SptssbQ925E8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SptssbQ925E8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SptssbQ925E8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SptssbQ925E8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SptssbQ925E8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SptssbQ925E8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptssbQ925E8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptssbQ925E8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SptssbQ925E8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SptssbQ925E8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SptssbQ925E8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SptssbQ925E8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SptssbQ925E8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SptssbQ925E8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SptssbQ925E8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SptssbQ925E8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SptssbQ925E8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SptssbQ925E8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SptssbQ925E8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SptssbQ925E8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SptssbQ925E8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptssbQ925E8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptssbQ925E8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptssbQ925E8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SptssbQ925E8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SptssbQ925E8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SptssbQ925E8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SptssbQ925E8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SptssbQ925E8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SptssbQ925E8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptssbQ925E8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SptssbQ925E8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SptssbQ925E8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SptssbQ925E8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SptssbQ925E8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptssbQ925E8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptssbQ925E8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptssbQ925E8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptssbQ925E8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptssbQ925E8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptssbQ925E8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SptssbQ925E8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SptssbQ925E8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SptssbQ925E8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SptssbQ925E8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SptssbQ925E8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptssbQ925E8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SptssbQ925E8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SptssbQ925E8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptssbQ925E8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptssbQ925E8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptssbQ925E8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptssbQ925E8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptssbQ925E8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SptssbQ925E8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptssbQ925E8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptssbQ925E8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms