Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV7

Defb38, Beta-defensin 38, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb38Q7TNV7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Defb38Q7TNV7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Defb38Q7TNV7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,33■□□□□ 0,53
Defb38Q7TNV7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Defb38Q7TNV7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Defb38Q7TNV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Defb38Q7TNV7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Defb38Q7TNV7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18,03■□□□□ 0,48
Defb38Q7TNV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Defb38Q7TNV7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Defb38Q7TNV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Defb38Q7TNV7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17,32■□□□□ 0,36
Defb38Q7TNV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defb38Q7TNV7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defb38Q7TNV7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Defb38Q7TNV7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Defb38Q7TNV7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Defb38Q7TNV7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Defb38Q7TNV7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Defb38Q7TNV7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17,07■□□□□ 0,32
Defb38Q7TNV7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Defb38Q7TNV7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Defb38Q7TNV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Defb38Q7TNV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defb38Q7TNV7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defb38Q7TNV7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Defb38Q7TNV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defb38Q7TNV7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defb38Q7TNV7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defb38Q7TNV7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defb38Q7TNV7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defb38Q7TNV7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defb38Q7TNV7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defb38Q7TNV7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defb38Q7TNV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defb38Q7TNV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defb38Q7TNV7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Defb38Q7TNV7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defb38Q7TNV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defb38Q7TNV7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16,41■□□□□ 0,22
Defb38Q7TNV7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Defb38Q7TNV7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16,39■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,36■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,34■□□□□ 0,21
Defb38Q7TNV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defb38Q7TNV7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defb38Q7TNV7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb38Q7TNV7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb38Q7TNV7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb38Q7TNV7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb38Q7TNV7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defb38Q7TNV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Defb38Q7TNV7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defb38Q7TNV7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Defb38Q7TNV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Defb38Q7TNV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Defb38Q7TNV7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15,98■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Defb38Q7TNV7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Defb38Q7TNV7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Defb38Q7TNV7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,89■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15,83■□□□□ 0,13
Defb38Q7TNV7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC15,79■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defb38Q7TNV7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defb38Q7TNV7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms