RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Krtap13O88375 197 aa12.51□□□□□ -0.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa12.51□□□□□ -0.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa12.51□□□□□ -0.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SnurfQ9WU12 71 aa12.51□□□□□ -0.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnah5Q8VHE6 4621 aa12.51□□□□□ -0.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Serp1Q9Z1W5 66 aa12.48□□□□□ -0.41
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Brk1Q91VR8 75 aa12.41□□□□□ -0.42
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ApobE9Q414 4505 aa12.41□□□□□ -0.42
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pkd1O08852 4293 aa12.39□□□□□ -0.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hectd4E9Q2E4 4418 aa12.35□□□□□ -0.43
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm2696A0A1W2P709 240 aa12.33□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Defb12Q8K4N3 78 aa12.33□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Coa5Q99M07 74 aa12.32□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10267M0QWD8 85 aa12.3□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Spaca4Q80ZQ0 127 aa12.3□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SvipQ3UZP4 77 aa12.28□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dph3Q8K0W9 82 aa12.28□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cypt15B1AXS0 87 aa12.28□□□□□ -0.44
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa12.27□□□□□ -0.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrpl55Q9CZ83 127 aa12.25□□□□□ -0.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Chtf8P0CG14 533 aa12.23□□□□□ -0.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wfdc3Q14AE4 130 aa12.23□□□□□ -0.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 H2al1aQ5M8Q2 105 aa12.22□□□□□ -0.45
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Defb13Q8R2I4 64 aa12.18□□□□□ -0.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrp1bQ9JI18 4599 aa12.17□□□□□ -0.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stard9Q80TF6 4561 aa12.16□□□□□ -0.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10160F6Y577 67 aa12.15□□□□□ -0.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa12.15□□□□□ -0.46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa12.09□□□□□ -0.47
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10197F6QEY5 67 aa12.08□□□□□ -0.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rps29P62274 56 aa12.02□□□□□ -0.48
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pkhd1E9PZ36 4059 aa12.01□□□□□ -0.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10643Q3URG9 111 aa12□□□□□ -0.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 RetnlbQ99P86 105 aa11.99□□□□□ -0.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fat2Q5F226 4351 aa11.97□□□□□ -0.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Defb38Q7TNV7 63 aa11.96□□□□□ -0.49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Phxr4P15974 95 aa11.93□□□□□ -0.5
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SacsQ9JLC8 4582 aa11.93□□□□□ -0.5
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ryr3A2AGL3 4863 aa11.85□□□□□ -0.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm21798J3QNU5 87 aa11.85□□□□□ -0.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm26620Q9CY65 116 aa11.84□□□□□ -0.51
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10337F7DEP7 55 aa11.83□□□□□ -0.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa11.77□□□□□ -0.52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 H2al1eQ810S6 105 aa11.77□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm20661K7N787 53 aa11.76□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm10999F6Q4M4 69 aa11.74□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 H2al1bA0A087WP11 105 aa11.74□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 H2al1kJ3QP08 105 aa11.74□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 H2al1mQ9DAD9 105 aa11.74□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Krtap3-2Q9D638 99 aa11.72□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa11.72□□□□□ -0.53
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Q8BGJ3 129 aa11.69□□□□□ -0.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sox16Q62247 57 aa11.68□□□□□ -0.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ryr1E9PZQ0 5035 aa11.68□□□□□ -0.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm11939A2A592 99 aa11.67□□□□□ -0.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 2310034C09RikQ9D746 214 aa11.65□□□□□ -0.54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 A930033H14RikG5E8X6 103 aa11.64□□□□□ -0.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ndufb1P0DN34 57 aa11.62□□□□□ -0.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Krtap19-5O08632 62 aa11.62□□□□□ -0.55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa11.58□□□□□ -0.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Vps13bQ80TY5 3993 aa11.57□□□□□ -0.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa11.56□□□□□ -0.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Limd2Q8BGB5 128 aa11.55□□□□□ -0.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Uqcr11Q9CPX8 56 aa11.54□□□□□ -0.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm4491E0CX42 125 aa11.53□□□□□ -0.56
Ube2b-201ENSMUST00000020657 4933415A04RikQ9D443 101 aa11.5□□□□□ -0.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa11.49□□□□□ -0.57
Ube2b-201ENSMUST00000020657 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa11.45□□□□□ -0.58
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SptssbQ925E8 76 aa11.45□□□□□ -0.58
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa11.44□□□□□ -0.58
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnah8Q91XQ0 4731 aa11.38□□□□□ -0.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fat3Q8BNA6 4555 aa11.36□□□□□ -0.59
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Defb1P56386 69 aa11.31□□□□□ -0.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 9230102O04RikA2ASX7 82 aa11.29□□□□□ -0.6
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa11.26□□□□□ -0.61
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm5965D3Z724 196 aa11.17□□□□□ -0.62
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rpl37Q9D823 97 aa11.17□□□□□ -0.62
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rnase13Q5GAM7 153 aa11.13□□□□□ -0.63
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa11.1□□□□□ -0.63
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cox6b2Q80ZN9 88 aa11.07□□□□□ -0.64
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abca13Q5SSE9 5034 aa11.06□□□□□ -0.64
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm3646F6S692 53 aa11□□□□□ -0.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sec61gP60060 68 aa11□□□□□ -0.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm9821Q8K076 103 aa10.98□□□□□ -0.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa10.97□□□□□ -0.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa10.96□□□□□ -0.65
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm17416Q30KP4 66 aa10.95□□□□□ -0.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Herc2Q4U2R1 4836 aa10.9□□□□□ -0.66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ndufs5Q99LY9 106 aa10.83□□□□□ -0.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Birc6O88738 4882 aa10.82□□□□□ -0.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa10.8□□□□□ -0.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm17606F6ZL36 78 aa10.77□□□□□ -0.68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PcloQ9QYX7 5068 aa10.69□□□□□ -0.7
Ube2b-201ENSMUST00000020657 HydinQ80W93 5154 aa10.63□□□□□ -0.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa10.63□□□□□ -0.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm9955Q8CEJ8 102 aa10.62□□□□□ -0.71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 1700042G07RikB1AUF7 90 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.8 ms