Protein–RNA interactions for Protein: Q91VR8

Brk1, Protein BRICK1, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brk1Q91VR8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Brk1Q91VR8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Brk1Q91VR8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Brk1Q91VR8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Brk1Q91VR8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Brk1Q91VR8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Brk1Q91VR8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Brk1Q91VR8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18,71■□□□□ 0,59
Brk1Q91VR8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Brk1Q91VR8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,62■□□□□ 0,57
Brk1Q91VR8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Brk1Q91VR8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Brk1Q91VR8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,54■□□□□ 0,56
Brk1Q91VR8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
Brk1Q91VR8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,51■□□□□ 0,55
Brk1Q91VR8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Brk1Q91VR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18,39■□□□□ 0,53
Brk1Q91VR8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Brk1Q91VR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Brk1Q91VR8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Brk1Q91VR8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Brk1Q91VR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Brk1Q91VR8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Brk1Q91VR8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Brk1Q91VR8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Brk1Q91VR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Brk1Q91VR8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Brk1Q91VR8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Brk1Q91VR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17,83■□□□□ 0,45
Brk1Q91VR8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Brk1Q91VR8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,8■□□□□ 0,44
Brk1Q91VR8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Brk1Q91VR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Brk1Q91VR8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Brk1Q91VR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Brk1Q91VR8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17,64■□□□□ 0,41
Brk1Q91VR8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Brk1Q91VR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Brk1Q91VR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Brk1Q91VR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Brk1Q91VR8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Brk1Q91VR8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Brk1Q91VR8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Brk1Q91VR8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17,46■□□□□ 0,39
Brk1Q91VR8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Brk1Q91VR8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17,33■□□□□ 0,37
Brk1Q91VR8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Brk1Q91VR8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,3■□□□□ 0,36
Brk1Q91VR8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17,3■□□□□ 0,36
Brk1Q91VR8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Brk1Q91VR8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Brk1Q91VR8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Brk1Q91VR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Brk1Q91VR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Brk1Q91VR8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Brk1Q91VR8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Brk1Q91VR8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Brk1Q91VR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Brk1Q91VR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,34
Brk1Q91VR8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Brk1Q91VR8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Brk1Q91VR8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Brk1Q91VR8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Brk1Q91VR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Brk1Q91VR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Brk1Q91VR8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,31
Brk1Q91VR8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,98■□□□□ 0,31
Brk1Q91VR8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Brk1Q91VR8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Brk1Q91VR8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Brk1Q91VR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Brk1Q91VR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,3
Brk1Q91VR8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,84■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
Brk1Q91VR8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,78■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,28
Brk1Q91VR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Brk1Q91VR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Brk1Q91VR8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Brk1Q91VR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms