RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NischQ80TM9 1593 aa42,5■■■■■ 4,39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa42,24■■■■■ 4,35
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc9P70170 1546 aa41,32■■■■■ 4,21
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Abcc8B2RUS7 1588 aa40,53■■■■■ 4,08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rhox8Q6VSS7 320 aa38,54■■■■□ 3,76
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rtl1Q7M732 1744 aa38,12■■■■□ 3,69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 ScribQ80U72 1612 aa37,96■■■■□ 3,67
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37,94■■■■□ 3,66
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37,2■■■■□ 3,55
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm5dQ62240 1548 aa37,18■■■■□ 3,54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc180J3QNE4 1664 aa37,18■■■■□ 3,54
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NacadQ5SWP3 1504 aa37,05■■■■□ 3,52
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Baz1aO88379 1555 aa36,83■■■■□ 3,49
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP36,64■■■■□ 3,46
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Crybg2B7ZCC2 1516 aa36,4■■■■□ 3,42
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sycp2Q9CUU3 1500 aa36,23■■■■□ 3,39
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35,94■■■■□ 3,34
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa35,73■■■■□ 3,31
Ube2b-201ENSMUST00000020657 HrcG5E8J6 738 aa35,41■■■■□ 3,26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 BicraF8VPZ9 1578 aa35,39■■■■□ 3,26
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Trim41Q5NCC3 630 aa35,35■■■■□ 3,25
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35,07■■■■□ 3,2
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34,99■■■■□ 3,19
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Synj1Q8CHC4 1574 aa34,7■■■■□ 3,15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CftrP26361 1476 aa34,58■■■■□ 3,13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34,58■■■■□ 3,13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep164Q5DU05 1446 aa34,55■■■■□ 3,12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34,53■■■■□ 3,12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Golga3P55937 1487 aa34,48■■■■□ 3,11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cngb1E1AZ71 1325 aa34,3■■■■□ 3,08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Top2bQ64511 1612 aa34,2■■■■□ 3,07
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34,17■■■■□ 3,06
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa34,12■■■■□ 3,05
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34,12■■■■□ 3,05
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP34,11■■■■□ 3,05
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP34,06■■■■□ 3,04
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa33,99■■■■□ 3,03
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Chic1Q8CBW7 227 aa33,96■■■■□ 3,03
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa33,95■■■■□ 3,02
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33,75■■■□□ 2,99
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fmn1Q05860 1466 aa33,72■■■□□ 2,99
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP33,58■■■□□ 2,97
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Wdr62Q3U3T8 1523 aa33,53■■■□□ 2,96
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gab3Q8BSM5 595 aa33,49■■■□□ 2,95
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Frmpd1A2AKB4 1549 aa33,47■■■□□ 2,95
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33,46■■■□□ 2,95
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP33,43■■■□□ 2,94
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33,42■■■□□ 2,94
Ube2b-201ENSMUST00000020657 TnnQ80Z71 1560 aa33,35■■■□□ 2,93
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33,23■■■□□ 2,91
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33,16■■■□□ 2,9
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Unc13aQ4KUS2 1712 aa33,09■■■□□ 2,89
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP33,05■■■□□ 2,88
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cep162Q6ZQ06 1403 aa32,92■■■□□ 2,86
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif15Q6P9L6 1387 aa32,91■■■□□ 2,86
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP32,86■■■□□ 2,85
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP32,8■■■□□ 2,84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Camsap1A2AHC3 1581 aa32,78■■■□□ 2,84
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Npm2Q80W85 207 aa32,7■■■□□ 2,82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam135aQ6NS59 1506 aa32,69■■■□□ 2,82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ccdc18Q640L5 1455 aa32,68■■■□□ 2,82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NrkQ9R0G8 1455 aa32,66■■■□□ 2,82
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Shroom4Q1W617 1475 aa32,57■■■□□ 2,8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Grin2bQ01097 1482 aa32,51■■■□□ 2,8
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtprkP35822 1457 aa32,5■■■□□ 2,79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32,5■■■□□ 2,79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myt1lP97500 1187 aa32,49■■■□□ 2,79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Il27Q8K3I6 234 aa32,47■■■□□ 2,79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cux2P70298 1426 aa32,46■■■□□ 2,79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ubl4bQ9CQ84 188 aa32,45■■■□□ 2,79
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Map3k1P53349 1493 aa32,44■■■□□ 2,78
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Baz1bQ9Z277 1479 aa32,39■■■□□ 2,78
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Clip1Q922J3 1391 aa32,28■■■□□ 2,76
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP32,27■■■□□ 2,76
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32,21■■■□□ 2,75
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Efcab5A0JP43 1406 aa32,21■■■□□ 2,75
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mier1Q5UAK0 511 aa32,19■■■□□ 2,74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP32,19■■■□□ 2,74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eea1Q8BL66 1411 aa32,16■■■□□ 2,74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NefmP08553 848 aa32,16■■■□□ 2,74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32,16■■■□□ 2,74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP32,15■■■□□ 2,74
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Duox2A2AQ99 1517 aa32,05■■■□□ 2,72
Ube2b-201ENSMUST00000020657 UbtfP25976 765 aaKnown RBP32,03■■■□□ 2,72
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zeb1Q64318 1117 aa32,02■■■□□ 2,72
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arap1Q4LDD4 1452 aa32■■■□□ 2,71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Setd5Q5XJV7 1441 aa31,97■■■□□ 2,71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Erich3F6QRE9 1637 aa31,97■■■□□ 2,71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa31,96■■■□□ 2,71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mrc2Q64449 1479 aa31,95■■■□□ 2,71
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Carmil1Q6EDY6 1374 aa31,92■■■□□ 2,7
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31,91■■■□□ 2,7
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ankrd26Q811D2 1581 aa31,88■■■□□ 2,69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SynmQ70IV5 1561 aa31,84■■■□□ 2,69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa31,83■■■□□ 2,69
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Samd9lQ69Z37 1561 aa31,82■■■□□ 2,68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Crocc2F6XLV1 1638 aa31,81■■■□□ 2,68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif21aQ9QXL2 1672 aa31,79■■■□□ 2,68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tiam1Q60610 1591 aa31,78■■■□□ 2,68
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP31,72■■■□□ 2,67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14,8 ms