RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ly6hQ9WUC3 139 aa8.68□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav3-4A0A075B654 114 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pcp4P63054 62 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm9747Q810H1 104 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lgals4Q8K419 326 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q9DAQ5 155 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CtrlQ9ER05 264 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ociad2Q9D8W7 154 aa8.67□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cd99Q8VCN6 175 aa8.66□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa8.66□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa8.66□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Muc4Q8JZM8 3443 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smim1P0C8K7 78 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PemtQ61907 199 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cryba4Q9JJV0 196 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Foxc1Q61572 553 aa8.65□□□□□ -1.02
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Spry2Q9QXV8 315 aa8.65□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa8.64□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fxyd5P97808 178 aa8.63□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lage3Q9CR70 148 aa8.63□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ss18l2Q9D174 77 aa8.63□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10647E9Q8X0 124 aa8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Crip3Q6Q6R3 243 aa8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cox11Q6P8I6 275 aa8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Shisa2Q8QZV2 295 aa8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sigmar1O55242 223 aa8.62□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm9936Q8C864 160 aa8.61□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ube2d3P61079 147 aa8.61□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ube2d2P62838 147 aa8.61□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Spink13Q3UTS8 97 aa8.61□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Camk2n2Q78WH7 79 aa8.61□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 A0A286YE02 88 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Krtap24-1G3X9A2 248 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tfpi2O35536 230 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pglyrp4Q0VB07 374 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CdsnQ7TPC1 561 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ufsp1Q9CZP0 217 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Defa25Q5G864 92 aa8.6□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 E130114P18RikF6S0S7 154 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CrygdP04342 174 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CrygeQ03740 174 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf580Q9DB38 172 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trbv13-2A0A140T8N6 113 aa8.59□□□□□ -1.03
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa8.58□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ScxQ64124 207 aa8.58□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1700011M02RikB1AX35 88 aa8.58□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dph3Q8K0W9 82 aa8.58□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa8.57□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm7137J3QMW1 236 aa8.57□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Psmb11Q8BG41 302 aa8.57□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Defa23Q5G866 93 aa8.56□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 LbhQ9CX60 105 aa8.56□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Krtap27-1E9PX37 202 aa8.56□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cmya5Q70KF4 3739 aa8.55□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Xcl1P47993 114 aa8.55□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gpha2Q925Q5 128 aa8.55□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10251J3QPM5 127 aa8.54□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm7138L7N2C3 230 aa8.54□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm3238W4VSP7 230 aa8.54□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smim26Q3V460 107 aa8.54□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm17577J3QNF7 156 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpl39lQ9CQD0 51 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 9430069I07RikQ9CX21 111 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm20726G3UX18 150 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cox7b2Q9D2H1 82 aa8.53□□□□□ -1.04
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plac8l1Q08EJ0 177 aa8.52□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chchd7Q8K2Q5 85 aa8.52□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa8.52□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav4d-3A0A075B625 110 aa8.52□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Defa21Q8C1P2 93 aa8.52□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sfta2E9PXB6 77 aa8.52□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BC025920Q3US60 128 aa8.51□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10135F6TEE5 83 aa8.51□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ube2bP63147 152 aa8.5□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm2916Q9D9B9 127 aa8.5□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stab2Q8R4U0 2559 aa8.5□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa8.49□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tenm3Q9WTS6 2715 aa8.49□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PkigO70139 76 aa8.49□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa8.49□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BC048502Q80Y74 154 aa8.48□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Itpr2Q9Z329 2701 aa8.48□□□□□ -1.05
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PscaP57096 123 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms