Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Plac8l1Q08EJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plac8l1Q08EJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plac8l1Q08EJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plac8l1Q08EJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Plac8l1Q08EJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Plac8l1Q08EJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plac8l1Q08EJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plac8l1Q08EJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Plac8l1Q08EJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plac8l1Q08EJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plac8l1Q08EJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plac8l1Q08EJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plac8l1Q08EJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Plac8l1Q08EJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plac8l1Q08EJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plac8l1Q08EJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plac8l1Q08EJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plac8l1Q08EJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plac8l1Q08EJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plac8l1Q08EJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plac8l1Q08EJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plac8l1Q08EJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Plac8l1Q08EJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Plac8l1Q08EJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Plac8l1Q08EJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Plac8l1Q08EJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plac8l1Q08EJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Plac8l1Q08EJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plac8l1Q08EJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plac8l1Q08EJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plac8l1Q08EJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plac8l1Q08EJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plac8l1Q08EJ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plac8l1Q08EJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plac8l1Q08EJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plac8l1Q08EJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plac8l1Q08EJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plac8l1Q08EJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Plac8l1Q08EJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plac8l1Q08EJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Plac8l1Q08EJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plac8l1Q08EJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plac8l1Q08EJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plac8l1Q08EJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plac8l1Q08EJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plac8l1Q08EJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plac8l1Q08EJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plac8l1Q08EJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Plac8l1Q08EJ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plac8l1Q08EJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plac8l1Q08EJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plac8l1Q08EJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Plac8l1Q08EJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Plac8l1Q08EJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Plac8l1Q08EJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Plac8l1Q08EJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plac8l1Q08EJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plac8l1Q08EJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Plac8l1Q08EJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Plac8l1Q08EJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Plac8l1Q08EJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Plac8l1Q08EJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Plac8l1Q08EJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Plac8l1Q08EJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Plac8l1Q08EJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Plac8l1Q08EJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Plac8l1Q08EJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Plac8l1Q08EJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plac8l1Q08EJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Plac8l1Q08EJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plac8l1Q08EJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Plac8l1Q08EJ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plac8l1Q08EJ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plac8l1Q08EJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plac8l1Q08EJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plac8l1Q08EJ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plac8l1Q08EJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plac8l1Q08EJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plac8l1Q08EJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plac8l1Q08EJ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Plac8l1Q08EJ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plac8l1Q08EJ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plac8l1Q08EJ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plac8l1Q08EJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plac8l1Q08EJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plac8l1Q08EJ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plac8l1Q08EJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plac8l1Q08EJ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms