Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX21

9430069I07Rik, MCG131781, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430069I07RikQ9CX21 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
9430069I07RikQ9CX21 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
9430069I07RikQ9CX21 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
9430069I07RikQ9CX21 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
9430069I07RikQ9CX21 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,14■■□□□ 1,14
9430069I07RikQ9CX21 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
9430069I07RikQ9CX21 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
9430069I07RikQ9CX21 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
9430069I07RikQ9CX21 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
9430069I07RikQ9CX21 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
9430069I07RikQ9CX21 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,43■■□□□ 1,02
9430069I07RikQ9CX21 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
9430069I07RikQ9CX21 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
9430069I07RikQ9CX21 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
9430069I07RikQ9CX21 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
9430069I07RikQ9CX21 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
9430069I07RikQ9CX21 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
9430069I07RikQ9CX21 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
9430069I07RikQ9CX21 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
9430069I07RikQ9CX21 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
9430069I07RikQ9CX21 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
9430069I07RikQ9CX21 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
9430069I07RikQ9CX21 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
9430069I07RikQ9CX21 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,67■□□□□ 0,9
9430069I07RikQ9CX21 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
9430069I07RikQ9CX21 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
9430069I07RikQ9CX21 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
9430069I07RikQ9CX21 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20,4■□□□□ 0,86
9430069I07RikQ9CX21 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
9430069I07RikQ9CX21 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
9430069I07RikQ9CX21 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
9430069I07RikQ9CX21 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
9430069I07RikQ9CX21 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,25■□□□□ 0,83
9430069I07RikQ9CX21 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
9430069I07RikQ9CX21 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,24■□□□□ 0,83
9430069I07RikQ9CX21 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
9430069I07RikQ9CX21 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
9430069I07RikQ9CX21 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
9430069I07RikQ9CX21 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
9430069I07RikQ9CX21 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,09■□□□□ 0,81
9430069I07RikQ9CX21 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
9430069I07RikQ9CX21 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
9430069I07RikQ9CX21 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
9430069I07RikQ9CX21 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
9430069I07RikQ9CX21 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
9430069I07RikQ9CX21 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
9430069I07RikQ9CX21 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
9430069I07RikQ9CX21 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,83■□□□□ 0,77
9430069I07RikQ9CX21 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
9430069I07RikQ9CX21 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
9430069I07RikQ9CX21 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
9430069I07RikQ9CX21 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,71■□□□□ 0,75
9430069I07RikQ9CX21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,69■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,68■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,68■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,67■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,74
9430069I07RikQ9CX21 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
9430069I07RikQ9CX21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
9430069I07RikQ9CX21 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
9430069I07RikQ9CX21 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
9430069I07RikQ9CX21 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
9430069I07RikQ9CX21 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
9430069I07RikQ9CX21 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,42■□□□□ 0,7
9430069I07RikQ9CX21 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
9430069I07RikQ9CX21 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
9430069I07RikQ9CX21 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
9430069I07RikQ9CX21 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
9430069I07RikQ9CX21 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
9430069I07RikQ9CX21 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,29■□□□□ 0,68
9430069I07RikQ9CX21 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
9430069I07RikQ9CX21 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
9430069I07RikQ9CX21 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
9430069I07RikQ9CX21 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
9430069I07RikQ9CX21 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,2■□□□□ 0,66
9430069I07RikQ9CX21 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
9430069I07RikQ9CX21 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
9430069I07RikQ9CX21 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,13■□□□□ 0,65
9430069I07RikQ9CX21 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
9430069I07RikQ9CX21 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,07■□□□□ 0,64
9430069I07RikQ9CX21 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
9430069I07RikQ9CX21 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
9430069I07RikQ9CX21 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
9430069I07RikQ9CX21 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
9430069I07RikQ9CX21 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,99■□□□□ 0,63
9430069I07RikQ9CX21 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
9430069I07RikQ9CX21 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
9430069I07RikQ9CX21 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
9430069I07RikQ9CX21 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
9430069I07RikQ9CX21 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18,94■□□□□ 0,62
9430069I07RikQ9CX21 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
9430069I07RikQ9CX21 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18,91■□□□□ 0,62
9430069I07RikQ9CX21 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
9430069I07RikQ9CX21 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
9430069I07RikQ9CX21 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
9430069I07RikQ9CX21 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18,87■□□□□ 0,61
9430069I07RikQ9CX21 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
9430069I07RikQ9CX21 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms