Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Trbv13-2A0A140T8N6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Trbv13-2A0A140T8N6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Trbv13-2A0A140T8N6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Trbv13-2A0A140T8N6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,89■■□□□ 1,09
Trbv13-2A0A140T8N6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Trbv13-2A0A140T8N6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Trbv13-2A0A140T8N6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Trbv13-2A0A140T8N6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Trbv13-2A0A140T8N6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Trbv13-2A0A140T8N6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,33■■□□□ 1,01
Trbv13-2A0A140T8N6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Trbv13-2A0A140T8N6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Trbv13-2A0A140T8N6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Trbv13-2A0A140T8N6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Trbv13-2A0A140T8N6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Trbv13-2A0A140T8N6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Trbv13-2A0A140T8N6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Trbv13-2A0A140T8N6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Trbv13-2A0A140T8N6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Trbv13-2A0A140T8N6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Trbv13-2A0A140T8N6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Trbv13-2A0A140T8N6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Trbv13-2A0A140T8N6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Trbv13-2A0A140T8N6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Trbv13-2A0A140T8N6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,74■□□□□ 0,91
Trbv13-2A0A140T8N6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Trbv13-2A0A140T8N6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Trbv13-2A0A140T8N6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Trbv13-2A0A140T8N6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Trbv13-2A0A140T8N6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Trbv13-2A0A140T8N6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Trbv13-2A0A140T8N6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,2■□□□□ 0,82
Trbv13-2A0A140T8N6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Trbv13-2A0A140T8N6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Trbv13-2A0A140T8N6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Trbv13-2A0A140T8N6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Trbv13-2A0A140T8N6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Trbv13-2A0A140T8N6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Trbv13-2A0A140T8N6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
Trbv13-2A0A140T8N6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Trbv13-2A0A140T8N6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Trbv13-2A0A140T8N6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Trbv13-2A0A140T8N6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Trbv13-2A0A140T8N6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
Trbv13-2A0A140T8N6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Trbv13-2A0A140T8N6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
Trbv13-2A0A140T8N6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Trbv13-2A0A140T8N6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Trbv13-2A0A140T8N6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Trbv13-2A0A140T8N6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19,72■□□□□ 0,75
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Trbv13-2A0A140T8N6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Trbv13-2A0A140T8N6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Trbv13-2A0A140T8N6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Trbv13-2A0A140T8N6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Trbv13-2A0A140T8N6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Trbv13-2A0A140T8N6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Trbv13-2A0A140T8N6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19,42■□□□□ 0,7
Trbv13-2A0A140T8N6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Trbv13-2A0A140T8N6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Trbv13-2A0A140T8N6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,39■□□□□ 0,69
Trbv13-2A0A140T8N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
Trbv13-2A0A140T8N6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Trbv13-2A0A140T8N6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,69
Trbv13-2A0A140T8N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19,27■□□□□ 0,68
Trbv13-2A0A140T8N6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,27■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,23■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Trbv13-2A0A140T8N6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19,19■□□□□ 0,66
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