Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Pcp4P63054 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Pcp4P63054 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Pcp4P63054 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Pcp4P63054 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Pcp4P63054 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Pcp4P63054 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Pcp4P63054 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Pcp4P63054 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Pcp4P63054 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Pcp4P63054 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Pcp4P63054 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Pcp4P63054 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Pcp4P63054 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Pcp4P63054 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Pcp4P63054 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Pcp4P63054 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Pcp4P63054 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Pcp4P63054 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Pcp4P63054 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Pcp4P63054 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Pcp4P63054 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Pcp4P63054 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Pcp4P63054 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Pcp4P63054 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Pcp4P63054 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Pcp4P63054 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,33■□□□□ 0,84
Pcp4P63054 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Pcp4P63054 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pcp4P63054 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pcp4P63054 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Pcp4P63054 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Pcp4P63054 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,15■□□□□ 0,82
Pcp4P63054 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Pcp4P63054 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Pcp4P63054 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,01■□□□□ 0,79
Pcp4P63054 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Pcp4P63054 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Pcp4P63054 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Pcp4P63054 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Pcp4P63054 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Pcp4P63054 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Pcp4P63054 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Pcp4P63054 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Pcp4P63054 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Pcp4P63054 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Pcp4P63054 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Pcp4P63054 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Pcp4P63054 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Pcp4P63054 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19,52■□□□□ 0,71
Pcp4P63054 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Pcp4P63054 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Pcp4P63054 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Pcp4P63054 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Pcp4P63054 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Pcp4P63054 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Pcp4P63054 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Pcp4P63054 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Pcp4P63054 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Pcp4P63054 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,42■□□□□ 0,7
Pcp4P63054 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,69
Pcp4P63054 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,69
Pcp4P63054 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Pcp4P63054 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Pcp4P63054 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Pcp4P63054 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Pcp4P63054 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,21■□□□□ 0,67
Pcp4P63054 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,16■□□□□ 0,66
Pcp4P63054 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Pcp4P63054 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Pcp4P63054 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Pcp4P63054 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pcp4P63054 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Pcp4P63054 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Pcp4P63054 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Pcp4P63054 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Pcp4P63054 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Pcp4P63054 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pcp4P63054 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pcp4P63054 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Pcp4P63054 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Pcp4P63054 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Pcp4P63054 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18,98■□□□□ 0,63
Pcp4P63054 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Pcp4P63054 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Pcp4P63054 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Pcp4P63054 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Pcp4P63054 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Pcp4P63054 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,83■□□□□ 0,61
Pcp4P63054 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Pcp4P63054 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms