Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa23Q5G866 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa23Q5G866 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Defa23Q5G866 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa23Q5G866 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa23Q5G866 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa23Q5G866 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Defa23Q5G866 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Defa23Q5G866 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa23Q5G866 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa23Q5G866 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Defa23Q5G866 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Defa23Q5G866 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa23Q5G866 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa23Q5G866 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa23Q5G866 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa23Q5G866 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa23Q5G866 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa23Q5G866 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa23Q5G866 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa23Q5G866 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa23Q5G866 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa23Q5G866 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa23Q5G866 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa23Q5G866 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa23Q5G866 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa23Q5G866 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa23Q5G866 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa23Q5G866 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa23Q5G866 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Defa23Q5G866 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa23Q5G866 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Defa23Q5G866 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Defa23Q5G866 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa23Q5G866 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Defa23Q5G866 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Defa23Q5G866 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa23Q5G866 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Defa23Q5G866 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa23Q5G866 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa23Q5G866 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa23Q5G866 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa23Q5G866 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa23Q5G866 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa23Q5G866 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa23Q5G866 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa23Q5G866 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa23Q5G866 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa23Q5G866 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa23Q5G866 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa23Q5G866 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa23Q5G866 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa23Q5G866 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa23Q5G866 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa23Q5G866 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa23Q5G866 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Defa23Q5G866 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa23Q5G866 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa23Q5G866 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa23Q5G866 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa23Q5G866 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa23Q5G866 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa23Q5G866 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa23Q5G866 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa23Q5G866 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa23Q5G866 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa23Q5G866 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa23Q5G866 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa23Q5G866 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa23Q5G866 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa23Q5G866 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa23Q5G866 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa23Q5G866 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa23Q5G866 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa23Q5G866 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa23Q5G866 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa23Q5G866 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa23Q5G866 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa23Q5G866 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa23Q5G866 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms