Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV0

Cryba4, Beta-crystallin A4, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba4Q9JJV0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Cryba4Q9JJV0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Cryba4Q9JJV0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Cryba4Q9JJV0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cryba4Q9JJV0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Cryba4Q9JJV0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Cryba4Q9JJV0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Cryba4Q9JJV0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Cryba4Q9JJV0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,38■■□□□ 1,17
Cryba4Q9JJV0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Cryba4Q9JJV0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Cryba4Q9JJV0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Cryba4Q9JJV0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Cryba4Q9JJV0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Cryba4Q9JJV0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Cryba4Q9JJV0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cryba4Q9JJV0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Cryba4Q9JJV0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Cryba4Q9JJV0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Cryba4Q9JJV0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
Cryba4Q9JJV0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cryba4Q9JJV0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Cryba4Q9JJV0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Cryba4Q9JJV0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Cryba4Q9JJV0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cryba4Q9JJV0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cryba4Q9JJV0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cryba4Q9JJV0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cryba4Q9JJV0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cryba4Q9JJV0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Cryba4Q9JJV0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cryba4Q9JJV0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cryba4Q9JJV0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cryba4Q9JJV0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Cryba4Q9JJV0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Cryba4Q9JJV0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cryba4Q9JJV0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cryba4Q9JJV0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Cryba4Q9JJV0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cryba4Q9JJV0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cryba4Q9JJV0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cryba4Q9JJV0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,58■□□□□ 0,89
Cryba4Q9JJV0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cryba4Q9JJV0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Cryba4Q9JJV0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cryba4Q9JJV0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Cryba4Q9JJV0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Cryba4Q9JJV0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Cryba4Q9JJV0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cryba4Q9JJV0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cryba4Q9JJV0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cryba4Q9JJV0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cryba4Q9JJV0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Cryba4Q9JJV0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Cryba4Q9JJV0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,08■□□□□ 0,81
Cryba4Q9JJV0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cryba4Q9JJV0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cryba4Q9JJV0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cryba4Q9JJV0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20■□□□□ 0,79
Cryba4Q9JJV0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cryba4Q9JJV0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cryba4Q9JJV0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cryba4Q9JJV0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cryba4Q9JJV0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cryba4Q9JJV0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cryba4Q9JJV0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cryba4Q9JJV0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Cryba4Q9JJV0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Cryba4Q9JJV0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cryba4Q9JJV0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cryba4Q9JJV0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cryba4Q9JJV0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,81■□□□□ 0,76
Cryba4Q9JJV0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cryba4Q9JJV0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cryba4Q9JJV0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cryba4Q9JJV0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cryba4Q9JJV0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cryba4Q9JJV0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Cryba4Q9JJV0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cryba4Q9JJV0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,66■□□□□ 0,74
Cryba4Q9JJV0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19,63■□□□□ 0,73
Cryba4Q9JJV0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Cryba4Q9JJV0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Cryba4Q9JJV0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Cryba4Q9JJV0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Cryba4Q9JJV0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Cryba4Q9JJV0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,57■□□□□ 0,72
Cryba4Q9JJV0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,53■□□□□ 0,72
Cryba4Q9JJV0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Cryba4Q9JJV0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Cryba4Q9JJV0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Cryba4Q9JJV0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,48■□□□□ 0,71
Cryba4Q9JJV0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Cryba4Q9JJV0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Cryba4Q9JJV0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Cryba4Q9JJV0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Cryba4Q9JJV0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Cryba4Q9JJV0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,39■□□□□ 0,69
Cryba4Q9JJV0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Cryba4Q9JJV0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms