Protein–RNA interactions for Protein: E9PX37

Krtap27-1, Keratin-associated protein 27-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap27-1E9PX37 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Krtap27-1E9PX37 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krtap27-1E9PX37 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krtap27-1E9PX37 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krtap27-1E9PX37 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krtap27-1E9PX37 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krtap27-1E9PX37 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krtap27-1E9PX37 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap27-1E9PX37 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krtap27-1E9PX37 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krtap27-1E9PX37 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krtap27-1E9PX37 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krtap27-1E9PX37 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krtap27-1E9PX37 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krtap27-1E9PX37 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap27-1E9PX37 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krtap27-1E9PX37 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krtap27-1E9PX37 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krtap27-1E9PX37 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krtap27-1E9PX37 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krtap27-1E9PX37 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krtap27-1E9PX37 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krtap27-1E9PX37 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krtap27-1E9PX37 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krtap27-1E9PX37 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krtap27-1E9PX37 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krtap27-1E9PX37 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krtap27-1E9PX37 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krtap27-1E9PX37 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krtap27-1E9PX37 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap27-1E9PX37 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap27-1E9PX37 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap27-1E9PX37 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krtap27-1E9PX37 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krtap27-1E9PX37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krtap27-1E9PX37 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krtap27-1E9PX37 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap27-1E9PX37 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap27-1E9PX37 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap27-1E9PX37 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krtap27-1E9PX37 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap27-1E9PX37 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap27-1E9PX37 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap27-1E9PX37 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap27-1E9PX37 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap27-1E9PX37 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap27-1E9PX37 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krtap27-1E9PX37 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krtap27-1E9PX37 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krtap27-1E9PX37 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krtap27-1E9PX37 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Krtap27-1E9PX37 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krtap27-1E9PX37 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krtap27-1E9PX37 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krtap27-1E9PX37 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krtap27-1E9PX37 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krtap27-1E9PX37 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krtap27-1E9PX37 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krtap27-1E9PX37 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap27-1E9PX37 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krtap27-1E9PX37 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krtap27-1E9PX37 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krtap27-1E9PX37 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krtap27-1E9PX37 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krtap27-1E9PX37 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krtap27-1E9PX37 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krtap27-1E9PX37 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krtap27-1E9PX37 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krtap27-1E9PX37 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krtap27-1E9PX37 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krtap27-1E9PX37 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krtap27-1E9PX37 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krtap27-1E9PX37 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krtap27-1E9PX37 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krtap27-1E9PX37 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krtap27-1E9PX37 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krtap27-1E9PX37 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krtap27-1E9PX37 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krtap27-1E9PX37 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krtap27-1E9PX37 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap27-1E9PX37 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap27-1E9PX37 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap27-1E9PX37 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krtap27-1E9PX37 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krtap27-1E9PX37 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krtap27-1E9PX37 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krtap27-1E9PX37 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krtap27-1E9PX37 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krtap27-1E9PX37 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krtap27-1E9PX37 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krtap27-1E9PX37 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krtap27-1E9PX37 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krtap27-1E9PX37 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krtap27-1E9PX37 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krtap27-1E9PX37 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krtap27-1E9PX37 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krtap27-1E9PX37 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krtap27-1E9PX37 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krtap27-1E9PX37 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krtap27-1E9PX37 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms